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Regulación Eucariote

Primera clase de Biología molecular

TermDefinition
¿Cuátos pares Pb hay en el genoma humano 3 200 millones de pb
Promotor Es una secuencia del DNA que inicia la transcripción del gen (TSS). Están localizados al inicio en la misma cadena en upstream Variación de tamaño de 100 a 1000 pb. Sirven para reclutar la maquinaria transcripcional RNA pol II
Promotor exclusivo de los eucariotes La caja TATA De los promotores humanos la tienen localizada entre -25 y -30
¿Qué son las secuencias reguladoras distales? Son secuecias relativamente lejos del core promoter y que se unen a factores de transcripción .
¿Qúe son los factores de transcripción? Son proteínas que reconocen secuencias especficas en el DNA y pueden activar o reprimir la transcripción.
¿El mismo gen puede ser controlado por distintos TF que compiten por el DNA? Si, y pueden ser Activadores y represores
Menciona algunos de los sitios especificos de TF GATA1 FOSC1 PBX1 HOXA2 MEXO2
¿Cómo actua Leucine Zipper? El extremo carboxilo interaccionan entre sí gracias a la interacción entre cadenas laterales de leucina y en el otro (amino) lo hacen con secuencias específicas de bases en el surco mayor del ADN.
¿Qué hace AP1? Hace las interraciones no covalentes de la Leucina formando ek dimero (Zipper de Leucina).
¿Un mismo factor de transcripción tiene la capacidad de activar en inhibir diferentes vías? Si
¿Qué hay en el nucleolo? Hay secuencias repetidas de genes ribosomales. Se repiten entre 300-400 veces en 5 cromosomas y están transcritos por la RNA pol I.
Cariotipo en humanos 22 pares de autosomas + 2 cromosomas sexuales no pares.
Telómeros Región del DNA repetitivo que se encuentra al final de los cromosomas. Sirven de protección para que no se dañen los cromosomas previniendo la degradación y la fusión cromosomica. Miden 11kb al nacer y se acortan a 4kb en adultos humanos. TTAGG
¿Que es la telomerasa y por que se encuentra sobrexpresada en tumores? Es la enzima que regenera los telomeros, y esto les permite a las céluas cancerosas estar "inmortalizadas" entre otras cosas.
Centrómero Es otro tipo de DNA repetitivo que ayuda a la división célular.
Compactación del DNA El DNA se va compactando en nucleosomas (un paquete de 8 histonas), donde el DNA da 2 vueltas o 146-147 pb por cada nucleosoma.
¿Cuáles son los 4 tipo de histonas principales? HISTONA: H3, H2A, H2B Y H4.
Eucromatina Son regiones claras del la cromatina (donde todo esta activado). Hay una mayor permeabilidad ya que usualmente esta activa la transcripción.
Heterocromatina Son regiones que se encuentran altamente compactadas donde va a ser más dificil que se exprese un gen. Facultativa: Son regiones que pueden cambiar estar activas en varios tejidos. Constitutivas: Siempre están reprimidas por el tipo donde se encuentran.
Cuál es el sitios de excepción de la Heterocromatina? El Nucleolo aunque se encuentra supercondensado si se expresa.
¿Cómo es que un gen puede pasar de un estado de Eucromatina a Heterocromatica? Este proceso se da cuando se esta diferenciando la célula.
Cromatina Es la combinación de DNA, proteínas y RNA (mezcla), ya que el DNA nunca se encuentra desnudo naturalmente.
Donde se dan las modificaciones de las histonas Histone tails (colitas de histonas).
¿Cómo se asocian las modificaciones de las histonas en el estado epigenetico del un gen en particular para estar encendidas (ON) o repremidas (OFF)? Las modificaciones que se asocian a la hipercompactación (metilación en DNA e histonas estan en OFF. Modificaciones que se asocian al estado permisivo a trasncripción estpan en ON (acetilación).
POLYCOMB Es un complejo que tiene varias unidades cataliticas (proteínas) que contribuyen al silenciamineto de genes. Tiene dos subunidades: PRC1; ubiquitina y PRC2; metila.
Epigenetica: Writing Son aquellas enzimas que se encargan de "escribir" en un gen si va a haber una activación o represión. Ejemplos: Metilasa, Acetilasa, fosforilasa.
Epigenetica: Erasing Son aquellas enzimas que se encargan de borrar las marcas de activación o repreción en un gen.
Created by: Fatima Tencle
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