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Regulación Eucariote
Primera clase de Biología molecular
Term | Definition |
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¿Cuátos pares Pb hay en el genoma humano | 3 200 millones de pb |
Promotor | Es una secuencia del DNA que inicia la transcripción del gen (TSS). Están localizados al inicio en la misma cadena en upstream Variación de tamaño de 100 a 1000 pb. Sirven para reclutar la maquinaria transcripcional RNA pol II |
Promotor exclusivo de los eucariotes | La caja TATA De los promotores humanos la tienen localizada entre -25 y -30 |
¿Qué son las secuencias reguladoras distales? | Son secuecias relativamente lejos del core promoter y que se unen a factores de transcripción . |
¿Qúe son los factores de transcripción? | Son proteínas que reconocen secuencias especficas en el DNA y pueden activar o reprimir la transcripción. |
¿El mismo gen puede ser controlado por distintos TF que compiten por el DNA? | Si, y pueden ser Activadores y represores |
Menciona algunos de los sitios especificos de TF | GATA1 FOSC1 PBX1 HOXA2 MEXO2 |
¿Cómo actua Leucine Zipper? | El extremo carboxilo interaccionan entre sí gracias a la interacción entre cadenas laterales de leucina y en el otro (amino) lo hacen con secuencias específicas de bases en el surco mayor del ADN. |
¿Qué hace AP1? | Hace las interraciones no covalentes de la Leucina formando ek dimero (Zipper de Leucina). |
¿Un mismo factor de transcripción tiene la capacidad de activar en inhibir diferentes vías? | Si |
¿Qué hay en el nucleolo? | Hay secuencias repetidas de genes ribosomales. Se repiten entre 300-400 veces en 5 cromosomas y están transcritos por la RNA pol I. |
Cariotipo en humanos | 22 pares de autosomas + 2 cromosomas sexuales no pares. |
Telómeros | Región del DNA repetitivo que se encuentra al final de los cromosomas. Sirven de protección para que no se dañen los cromosomas previniendo la degradación y la fusión cromosomica. Miden 11kb al nacer y se acortan a 4kb en adultos humanos. TTAGG |
¿Que es la telomerasa y por que se encuentra sobrexpresada en tumores? | Es la enzima que regenera los telomeros, y esto les permite a las céluas cancerosas estar "inmortalizadas" entre otras cosas. |
Centrómero | Es otro tipo de DNA repetitivo que ayuda a la división célular. |
Compactación del DNA | El DNA se va compactando en nucleosomas (un paquete de 8 histonas), donde el DNA da 2 vueltas o 146-147 pb por cada nucleosoma. |
¿Cuáles son los 4 tipo de histonas principales? | HISTONA: H3, H2A, H2B Y H4. |
Eucromatina | Son regiones claras del la cromatina (donde todo esta activado). Hay una mayor permeabilidad ya que usualmente esta activa la transcripción. |
Heterocromatina | Son regiones que se encuentran altamente compactadas donde va a ser más dificil que se exprese un gen. Facultativa: Son regiones que pueden cambiar estar activas en varios tejidos. Constitutivas: Siempre están reprimidas por el tipo donde se encuentran. |
Cuál es el sitios de excepción de la Heterocromatina? | El Nucleolo aunque se encuentra supercondensado si se expresa. |
¿Cómo es que un gen puede pasar de un estado de Eucromatina a Heterocromatica? | Este proceso se da cuando se esta diferenciando la célula. |
Cromatina | Es la combinación de DNA, proteínas y RNA (mezcla), ya que el DNA nunca se encuentra desnudo naturalmente. |
Donde se dan las modificaciones de las histonas | Histone tails (colitas de histonas). |
¿Cómo se asocian las modificaciones de las histonas en el estado epigenetico del un gen en particular para estar encendidas (ON) o repremidas (OFF)? | Las modificaciones que se asocian a la hipercompactación (metilación en DNA e histonas estan en OFF. Modificaciones que se asocian al estado permisivo a trasncripción estpan en ON (acetilación). |
POLYCOMB | Es un complejo que tiene varias unidades cataliticas (proteínas) que contribuyen al silenciamineto de genes. Tiene dos subunidades: PRC1; ubiquitina y PRC2; metila. |
Epigenetica: Writing | Son aquellas enzimas que se encargan de "escribir" en un gen si va a haber una activación o represión. Ejemplos: Metilasa, Acetilasa, fosforilasa. |
Epigenetica: Erasing | Son aquellas enzimas que se encargan de borrar las marcas de activación o repreción en un gen. |