click below
click below
Normal Size Small Size show me how
biochemia wykład 2
enzymy
Question | Answer |
---|---|
Rodzaje kofaktorów | - grupa prostetyczna -> na trwałe związana z apoenzymem - koenzym -> nietrwale związany z apoenzymem - aktywatory -> jony -> najczęściej kationy metali |
grupa prostetyczna | - Fosforan pirydoksalu w aminotransferazach (przenośnik wewnątrzenzymowy) - FMN, FAD, difosforan tiaminy, biotyna |
koenzymy | CoA, NAD+, NADP+, THF |
aktywatory | najczęściej Co, Cu, Mn, Mg, Zn |
Endogenne grupy prostetyczne / kofaktory | kwas liponowy, biopteryny |
Mechanizmy reakcji dwusubstratowych | - Sekwencyjny uporządkowany - Sekwencyjny o dowolnej kolejności - Typu ping-pong |
Kiedy mamy do czynienia z enzymem monomerycznym ? | - Gdy zbudowany jest z 1 łańcucha polipetydowego - Gdy zbudowany jest z 2 lub więcej łańcuchów polipeptydowych, ale połączonych mostkami disulfidowymi. Generalnie, w monomerze mamy tylko wiązania kowalencyjne. |
Enzym oligomeryczny | 2 lub więcej podjednostek połączonym wiązaniami NIEKOWALENCYJNYMI w procesie polimeryzacji, co najczęściej aktywuje enzym. |
kompleks dehydrogenazy pirogronianowej | pirogronian -> Acetylo CoA |
Izoenzymy | Katalizują taką samą reakcję produkty różnych genów, w różnych typach komórek, o różnej wrażliwości na czynniki regulatorowe i o różnym powinowactwie do substratów. przykład: Heksokinaza I Glukokinaza, LDH |
LDH - dehydrogenaza mleczanowa | Przekształca mleczan w pirogronian - Budowa tetrameryczna - 2 typy podjednostek: H (sercowy) i M (mięśniowy) - 5 izoenzymów LDH1 = H4 = B LDH5 = M4 = A |
6 klas enzymów | oksydoreduktazy -> katalizujące reakcje redox transferazy liazy ligazy (syntetazy) hydrolazy izomerazy |
oksydoreduktazy | Katalizują reakcje redox |
transferazy | Przenoszą określone grupy pomiędzy poszczególnymi związkami |
hydrolazy | Katalizują rozszczepienie różnych wiązań z udziałem cząsteczki wody. |
liazy | Katalizują rozszczepienie różnych wiązań bez udziału cząsteczki wody. |
ligazy (syntetazy) | Katalizują wytwarzanie wiązań między cząsteczkami substratów, zużywając ATP. |
izomerazy | katalizują reakcje izomeryzacji. |
centrum aktywne enzymu | Substrat przylega do: - Miejsca katalitycznego -> Aminokwasy kontaktowe i pomocnicze - Miejsca określającego swoistość -> Aminokwasy kontaktowe Poza centrum aktywnym znajdują się aminokwasy stabilizujące. |
jakie oddziaływania warunkują kompleks ES ? | - Wiązania wodorowe - Wiązania kowalencyjne - Siły van der Waalsa - Oddziaływania hydrofobowe - Oddziaływania elektrostatyczne |
Km | Stężenie substratu, przy którym prędkość początkowa reakcji stanowi połowę prędkości maksymalnej osiąganej przy danym stężeniu enzymu. |
Główna reakcja katalizowana przez heksokinazę | glukoza + ATP -> glukozo-6-fosforan + ADP |
Wykres Lineweavera - Burka | - Oś Y : 1/v - Oś X : 1/S Przecięcie Osi Y : 1/vmax Przecięcie Osi X : -(1/Km) nachylenie = (Km)/(Vmax) |
Kooperatywność | dotyczy wiązania ligandów (substratów, aktywatorów, inhibitorów) Gdy wiązanie cząsteczki ligandu z enzymem ma wpływ na wiązanie następnej cząsteczki ligandu przez ten enzym. jest to cecha enzymów multimerycznych |
Efekt homotropowy | Kiedy związanie cząsteczki ligandu x wpływa na wiązanie następnej cząsteczki ligandu x. |
Efekt heterotropowy | Kiedy związanie cząsteczki ligandu x wpływa na wiązanie cząsteczki ligandu y. |
Kooperatywność dodatnia | Kiedy w obecności cząsteczki ligandu (substratu) wzrasta wiązanie następnych cząsteczek ligandu (substratu) do enzymu. |
Kooperatywność ujemna (antykooperatywność) | Kiedy w obecności cząsteczki ligandu (substratu) hamowane jest wiązanie następnych cząsteczek ligandu (substratu) do enzymu. |
Eksperymentalne ustalanie kooperatywności enzymu i substratu | Wzrost wysycenia enzymu substratem z 10% do 90% osiągamy zwiększając stężenie substratu - 9-krotnie przy kooperatywności dodatniej - 81-krotnie przy braku kooperatywności - 6541-krotnie przy kooperatywności ujemnej |
I rząd reakcji (reakcja jednosubstratowa) | stężenie substratu ogranicza prędkość reakcji. |
II rząd reakcji (reakcja jednosubstratowa) | stężenie enzymu ogranicza prędkość reakcji. |
II rząd reakcji (reakcja dwusubstratowa) | prędkość jest proporcjonalna do iloczynu stężeń obu substratów. |
enzym w optymalnym pH | posiada COO- i NH3+. |
inhibicja nieodwracalna | ma kinetykę inhibicji niekompetycyjnej. nie odwraca jej dializa lub rozcieńczenie dotyczy najczęściej centrum aktywnego enzymu (blokowania lub modyfikacji określonych aminokwasów) |
reakcja kat. przez acetylocholinoesterazę | acetylocholina + H2O -> cholina + kwas octowy |
przykłady inhibicji nieodwracalnej | - inaktywacja acetylocholinoesterazy i chymotrypsyny przez DIPF (diizopropylofluorofosforan) - jodoacetamid (jodooctan) -> inaktywacja dehydrogenazy aldehydu 3-fosfoglicerynowego - inaktywacja cyklooksygenazy przez kwas salicylowy. |
statyny | inhibitory reduktazy HMG-CoA |
inhibicja kompetycyjna | - rywalizacja o centrum aktywne - strukturalne podobieństwo S i I - kompletne odwrócenie nadmiarem substratu |
inhibicja odwracalna | Ma kinetykę inhibicji kompetycyjnej: Zmienia Km, nie ma wpływu na Vmax. |
dehydrogenaza bursztynianowa | bursztynian -> fumaran |
inhibicja kompetycyjna dehydrogenazy alkoholowej | W przypadku zatrucia metanolem lub glikolem etylenowym, podajemy etanol, aby to jego zmetabolizowała dehydrogenaza alkoholowa (szczególnie, ab |
przykłady naturalnych inhibitorów enzymów | - trzustkowy inhibitor trypsyny - blokuje centrum aktywne trypsyny nie mylić z: - a1-antytrypsyna - hamuje proteazy osoczowe. jej niedobór prowadzi do rozedmy płuc. - inhibitory metaloproteinaz (TIMP) |
enzymy komórkowe | działają tylko w obrębie komórki - ich uwolnienie do osocza po śmierci komórki sprawia, że stają się niefunkcjonalne |
enzymy pozakomórkowe | Inaczej enzymy sekrecyjne. Są to np. enzymy osoczowe i enzymy przewodu pokarmowego. |
enzymy osoczowe | - biorące udział w procesach krzepnięcia - biorące udział w przemianach lipoprotein osocza - LCAT - acylotransferaza lecytyna-cholesterol |
nadmiar Aspat lub LDH w osoczu - jaki narząd jest uszkodzony ? | serce lub wątroba. Aktualnie Aspat to marker zawału serca. |
nadmiar Alat lub GDH w osoczu - jaki narząd jest uszkodzony ? | wątroba Alat - marker wirusowego zapalenia wątroby. |
nadmiar kinazy kreatynowej (CK) lub LDH w osoczu - jaki narząd jest uszkodzony ? | mięśnie szkieletowe |
jakie są generalne markery nieznacznego lub znacznego uszkodzenia komórki ? | Przy nieznacznym: 1. Alat 2. Aspat 3. GDH Przy znacznym: 1. Aspat 2. Alat 3. GDH |
enzymologiczna diagnostyka zawału serca od początku bólu zamostkowego | - Wariant CK-2 - LDH: Najpierw mamy peak CK-2, a potem łagodniejszy LDH. - Wariant Mioglobina - Troponina: Najpierw ostry peak Mioglobiny, a potem większy lub mniejszy Troponiny, w zależności od siły zawału mięśnia sercowego. |
Izoenzymy kinazy kreatynowej | BB (brain) -> CK-1 BM (heart) -> CK-2 MM (mięśnie szkieletowe) -> CK-3 |
jak działa kinaza kreatynowa ? | przekształca kreatynę w fosfokreatynę z użyciem ATP połączonego z Magnezem. Marker chorób mięśni i zawału serca. |
amylaza lub lipaza w osoczu | ostre zapalenie trzustki |
ceruloplazmina w osoczu | zwyrodnienie wątrobowo-soczewkowe (choroba Wilsona) |
Transpeptydaza gamma-glutamylowa w osoczu | Różne choroby wątroby |
Fosfataza kwaśna w osoczu | Rak gruczołu krokowego z przerzutami. |
Fosfataza alkaliczna w osoczu | Różne choroby kości lub choroby wątroby zw. z utrudnionym odpływem żółci. |
znaczenie diagnostyczne izoenzymów LDH - elektroforeza na octanie celulozy | Zdrowy człowiek ma najwięcej LDH2 - H3M Zawał serca - najwięcej LDH1 ostre zapalenie wątroby - LDH5 |
izoenzymy LDH - powtórka | LDH1 = H4 = B = Serce LDH5 = M4 = A = Mięśnie szkieletowe |
pośrednia metoda oznaczania stężenia glukozy lub etanolu we krwi | Enzymy, których aktywność oznaczamy: - Heksokinaza - Dehydrogenaza glukozo-6-fosforanowa - Oksydaza glukozy |
pośrednia metoda oznaczania stężenia etanolu we krwi | Enzym, którego aktywność oznaczamy: Dehydrogenaza alkoholowa (ADH) |
pośrednia metoda oznaczania stężenia cholesterolu we krwi | Enzymy, których aktywność oznaczamy: - Oksydaza cholesterolowa - Peroksydaza |
tkankowy aktywator plazminogenu (tPA) / streptokinaza jako leki | W zawale serca i udarze mózgu Przemieniają one plazminogen w plazminę, która rozkłada fibrynę - główny składnik skrzepu. |
asparaginaza jako lek | leczenie niektórych białaczek |
ludzka rekombinowana DNAza (rhDNAza) jako lek | hydroliza DNA zawartego w gęstej i lepkiej wydzelinie gromadzącej się w przewodach zewnątrzwydzielniczych układu oddechowego, trzustki i przewodu pokarmowego -> leczenie dzieci z mukowiscydozą |
Inhibitory ACE (konwertazy) - co robią ? | Hamują przekształcaenie Angiotensyny I do Angiotensyny II i przekształcanie bradykininy do jej metabolitów. |
czym są statyny ? | Są to Inhibitory Reduktazy HMG-CoA. Przekształca ona Acetylo-CoA do cholesterolu. |
sildenafil | inhibitor fosfodiesterazy typu V |
zastosowanie inhibitorów enzymów przewodu pokarmowego | w leczeniu otyłości. |
kwas mykofenolowy (Cell-cept) | lek immunosupresyjny Inhibitor dehydrogenazy IMP |
chemoterapeutyki przeciwwirusowe | inhibitory odwrotnej transkryptazy; polimerazy RNA-zależnej |
terapia celowana | skutecznie eliminuje komórki nowotworowe, nie uszkadzając komórek nienowotworowych |
leki stosowane w terapii celowanej | np. Inhibitory kinaz tyrozynowych: Gleevec, imatinib -> Selektywny inhibitor aktywności kinazy tyrozynowej w : - Białku fuzyjnym Bcr-Abl (przewlekła białaczka szpikowa - CML) - Receptorze cKit - Receptorze PDGF |
Biguanidy | np. Metformina : Stymuluje ona AMPK. |
Kalcyneuryna | uczestniczy w wewnątrzkomórkowej ścieżce sygnalizacyjnej prowadzącej do syntezy IL-2, które z kolei aktywuje limfocyty Th i indukuje w nich syntezę innych cytokin. Cyklosporyna, Cyklofilina lub Białko wiążące takrolimus będą hamować kalcyneurynę. |
role TIMPs - Tissue Inhibitors of MetaloProteinases - tkankowych inhibitorów metaloproteinaz | - we włóknieniu narządów - w przebudowie narządów - w powstawaniu przerzutów nowotworowych |
Hemaglutynina wirusa grypy i inhibitor neuraminidazy. | Ma zdolność wiązania się do kwasu sialowego (N-acetyloneuraminowego) na końcach glikoprotein błony komórkowej gospodarza. Neuraminidaza wirusa grypy odcina wtedy resztę kwasu kwasu sialowego gospodarza. Hamuje ją zanamiwir. |
Dlaczego Asparaginaza pełni rolę w leczeniu niektórych Białaczek ? | Ponieważ asparagina nie jest syntetyzowana w komórkach nowotworowych, ale jest cały czas do nich dostarczana. Asparaginaza sprawia więc, że w komórkach nowotworowych nie będą mogły być syntetyzowane białka. Prowadzi to do śmierci komórki nowotworowej. |
problem zw. z zast. asparaginazy w leczeniu białaczek | - ma krótki czas półtrwania - szybko wytwarzane są przeciwciała przeciwko asparaginazie - inne efekty uboczne |
co przekształca angiotensynogen do angiotensyny I ? | renina. inhibitory renin będą hamowały wzrost ciśnienia krwi. |
AT1 | Receptor Angiotensyny II typu I Jego aktywacja powoduje skurcz naczyń, wchłanianie zwrotne sodu, pogorszenie funkcji endotelium oraz wzrost transportu cholesterolu LDL. Jego blokery - sartany - obniżają ciśnienie krwi. |
jak inaczej możemy zapobiec wzrostowi ciśnienia, poczynając od Angiotensyny I ? | - ACE2 przekształca Angiotensynę I do Angiotensyny 1-9 -> 1-7 -> Rozszerza ona naczynia krwionośne : Antagonista angiotensyny II - niszczymy angiotensynę II peptydazami |
AT2 | Receptor Angiotensyny II typu II Przyłączenie się Angiotensyny II do niego powoduje rozkurcz naczyń., natiurezę i polepszenie funkcji endotelium. |
Katepsyna 9 | promuje przekształcanie się Angiotensynogenu i Angiotensyny I do Angiotensyny II. |