Inż Gen stare
Quiz yourself by thinking what should be in
each of the black spaces below before clicking
on it to display the answer.
Help!
|
|
||||
|---|---|---|---|---|---|
| Wektory ekspresyjne: | do produkcji białka rekombinowanego
🗑
|
||||
| Adaptory: | mogą być jednoniciowe, dwuniciowe (zazwyczaj), mogą być niekomplementarne, mogą łączyć koniec 3' z 5' albo 5' z 3'
🗑
|
||||
| Fragment Klenowa polimerazy I E coli: | wykorzystywany w znakowaniu random priming, ma aktywność egzonukleazy 3'-5', do znakowania schowanych 3', dawniej w sekwencjonowaniu
🗑
|
||||
| W procesie vectorette PCR: | wykorzystujemy jednoniciowy adaptor
DNA jest pociete enzymami restrykcyjnymi
wykorzystujemy proces ligacji
wykorzystujemy wektor do powielania DNA
🗑
|
||||
| Wektor binarny: | Może się replikować w E coli i u Agrobact (bo zawarte w nim ori RK2 funkcjonuje zarówno w E. coli jak i w Agrobact – zdolności autonomicznej replikacji u obu gospodarzy)
ma sekwencję homologiczną do Ti
T DNA jest ofiankowane sekwencjami granicznymi
🗑
|
||||
| Właściwość egzonukleazowa 5->3 polimerazy Taq: | sprawia że jest dokładna (1) (frekwencja błędów wynosi 2,2*10-5 na nukleotyd na cykl)
wykorzystywana w TaqMan (1) (jej aktywność egzonukleazy 5’-3’ jest wykorzystywana w technice real time PCR z wykorzystaniem sondy TaqMan)
🗑
|
||||
| Sekwencja TDNA plazmidu Ti | jest oflankowana sekwencjami LB i RB, jest transportowana do jądra komórek rośliny
🗑
|
||||
| Mikromacierze | hybrydyzacja kw. nukleinowych na podłożu stałym
🗑
|
||||
| Markery blisko sprzężone z poszukiwanym genem | u roślin o dużych genomach łatwiej znaleźć poszukiwany gen
🗑
|
||||
| Biblioteki chromosome jumping | - w technice chromose jumping zawsze występują z bibliotekami typu linking
- służą do przenoszenia między odległymi końcami fragmentów restrykcyjnych
-pomagają ominąć niemożliwe do sekwencjonowania fragmenty biblioteki
🗑
|
||||
| Nick translation | do znakowania DNA (1)
DNAza I (1)
używana pol.I E.coli do katalizowania procesu (1)
wykorzystuje właściwość polimerazy I 5’-3’ i egzonukleazy 5’-3’ (1)
🗑
|
||||
| BAC'i (sztuczne chromosomy bakteryjne są to odpowiednio przekonstruowane plazmidy płciowe E.coli) | - mogą występować w systemie binarnym
- wprowadza się je do komórki metodą elektroporacji
🗑
|
||||
| BAC | konstrukcja bibliotek genomowych, które służą do: izolacji określonych genów, mapowania fizycznego, sekwencjonowanie genomu. Klony w BAC’ach są często materiałem wyjściowym do syntezy sond dla eksperymentów FISH tzn. fluorescencyjnej hybrydyzacji in situ
🗑
|
||||
| RACE PCR: | - matryca to cDNA
- są dwie wersje metody które odpowiadają różnym końcom cząsteczki cDNA: 3’ RACE i 5’RACE)
🗑
|
||||
| Metoda cDNA AFLP (polimorfizm długości amplifikowanych fragmentów cDNA) | - stosujemy do syntezy ds DNA
- wykorzystujemy dwustopniowa amplifikację
🗑
|
||||
| W metodzie real time PCR współczynnik CT to: | wartość ta daje informacje o tym ile kopii docelowej sekwencji dostarczono z matrycą do reakcji
🗑
|
||||
| Starter arbitralny: | druga nić cDNA
🗑
|
||||
| Amplifikacja RNA: | RT-PCR
RACE-PCR
🗑
|
||||
| Synteza dsDNA pełnej długości odbywa się przy pomocy: | Odwrotnej transkryptazy, RnAzy H, fragmentu Klenowa, ligaza
🗑
|
||||
| His Taq w białku rekombinantowym: | -Zwykle nie wpływa znacząco na jego strukturę, funkcje i właściwości (spowodowane jest to małymi rozmiarami ogonka histydynowego tj. His Taq)
-Umożliwia detekcję Western Blot (metoda klasyczna, do detekcji można wykorzystać przeciwciało antyhistydynowe
🗑
|
||||
| YEp: (drożdżowe wektory episomalne) | Zawierają drożdżowy marker selekcyjny (HIS3, LEU2, LYS2, TRP1, URA3. Markery te komplementują (uzupełniają) specyficzne mutacje auksotroficzne)
Mogą się namnażać w komórkach drożdżowych i bakt (wahadłowe aut repl w E.Coli)
🗑
|
||||
| T DNA (transformujące DNA) plazmidu Ti Agrobacterium: | Ma odcinek flankujący prawą i lewą sekwencję(proste powtórzenia o długości 25 nukleotydów)
Jest przenoszone do jądra (bez tego proces nie zakończy się sukcesem z punktu widzenia bakterii. Przenoszenie zachodzi na zasadzie importu jądrowego)
🗑
|
||||
| Somatyczny transfer jądrowy: | Wykorzystuje enukleowane oocyty (przygotowane w warunkach in vitro fibroblasty poddaje się fuzji z enukleowanymi oocytami – czyli oocytami bez jąder)
🗑
|
||||
| Do Vectorette PCR: | Używamy starterów sekwencji znanej i adaptora
🗑
|
||||
| Hybrydyzacja różnicowa: | Służy do klonowania genów o różnym fenotypie (1)
Służy do wykrywania specyficznych transkryptów dla danej linii komórek (1)
🗑
|
||||
| Drożdżowe systemy dwuhybrydowe: | Czy DBD wiąże się z przynętą (1) (ekspresja wektora prowadzi do powstania białka fuzyjnego – jedna jego część odpowiada przynęcie, a druga – domenie DBD)
Czy AD wiąże się z zdobyczą (1) (PRAY-AD)
🗑
|
||||
| W toku testu opóźnienia w żelu (band shift assay): | - Białko oddziałujące z DNA zabezpiecza przed trawieniem przez DNazę I (1)
- Dodanie DNA niewyznakowanego ma konkurować z DNA wyznakowanym o wiązanie z białkiem i powoduje, że sygnał jest słabszy (1)
🗑
|
||||
| Przy konstrukcji bibliotek genomowych: | - Stosujemy elektroforezę pulsową (pulsacyjną kurwy głupie)
- Duża pojemność wektora zmniejsza szanse na znalezienie docelowej sekwencji
- Bazuje na ligacji
- Stosuje się fragmenty restrykcyjne genomowego DNA
🗑
|
||||
| Metoda postępujących (jednokierunkowych) delecji wykorzystuje: | Uniwers starter zakotwiczony w obrębie sekwencji wektora
Trawienie egzonukleaząIII
Można użyć do badania długich fragm
Stosujemy 2 enzymy: 1trawi w pobliżu insertu i generuje końce lepkie5’ albo tępe, 2 leży w oddaleniu od tamtego, robi lepkie końce3’
🗑
|
||||
| W metodzie FAR WESTERN: | możemy poznać tożsamość badanego białka
🗑
|
Review the information in the table. When you are ready to quiz yourself you can hide individual columns or the entire table. Then you can click on the empty cells to reveal the answer. Try to recall what will be displayed before clicking the empty cell.
To hide a column, click on the column name.
To hide the entire table, click on the "Hide All" button.
You may also shuffle the rows of the table by clicking on the "Shuffle" button.
Or sort by any of the columns using the down arrow next to any column heading.
If you know all the data on any row, you can temporarily remove it by tapping the trash can to the right of the row.
To hide a column, click on the column name.
To hide the entire table, click on the "Hide All" button.
You may also shuffle the rows of the table by clicking on the "Shuffle" button.
Or sort by any of the columns using the down arrow next to any column heading.
If you know all the data on any row, you can temporarily remove it by tapping the trash can to the right of the row.
Embed Code - If you would like this activity on your web page, copy the script below and paste it into your web page.
Normal Size Small Size show me how
Normal Size Small Size show me how
Created by:
vongrivatch
Popular Biology sets