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GeneXpress 03B

Transkription Euk

QuestionAnswer
Pol 1 im Kern große rRNA
Pol II im Kern pre-miRNA, miRNA,
Pol III im Kern tRNA, 5S-RNA,
RdRP RNA abhängie RNA Pol: in Cytoplasma,siRNA
welche Ähnlichkeit Haben alle Pol als Grundgerust Core- Enzym, besteht aus mehreren UE
woraus besteht Core Promoter BRE--TATA---INR---DPE
wo liegt TATA Box -25-35 upstream vom Start
Aufbau TATA Box Konsensusseq von AT reiche Region, daneben GC Bereiche, hier binden TF (TFIID mit TBP)
CAAT Box? liegt im Promoter, Konsensussequenz ist CAAT oder CCAAT, CAAT-Boxen sind Sites, an die Proteine (TFs) an die DNA binden. ◦ Wurden durch Mutationsanalysen ermittelt. -70-80bp
Reihenfolge bei Transk? CAAT->TFIID hat TBP-> TATAA-> TFIIA->TFIIb-> Pol
CpG- Inseln? Bereiche mit hoher CpG-Dinukleotid-Dichte. Cytosin-phosphatidyl-Guanosin,0,5kb bis 2kb Länge mit GC-Gehalt von über 60% 60-90% aller CpGs des Genoms von Säugetieren sind methyliert. Gen wird nicht abgelesen
CG-Box? meist wenn TATA-Box fehlt,wird vn TF SP1 erkannt,GC reich 20-50bp,100bp upstream vom Start, häufig mit multiple 5'-Startstellen
Was sind TF? Aufgabe? sie beeinflussen die Transkription positiv oder negativ, wie Aktivatoren und Repressoren.Binden an DNA. Haben 2 Domänen, eine binden an DNA andere Aktivator oder Repressor.
Allg TF? sie binden mit dem Core-Enzym in Promoter. TFIIA, B, D, E, F, H und TBP. sind wichtig für transk, aber sie regulieren NICHT die Transkription
Promoter Elemente in cis? cis Elemente liegen in definierte Lage: CAAT Box, GC-Box, TATA-Box, Octamer-Box
wie wurden Promoter elemente gefunden? bei einem Gen Basen durch Punktmutation ausgetauscht->an manchen Stellen (Punkte) hohe Transkription an anderen nicht oder gar nicht. An CAAT, CG und TATA boxen-> Reduktion der Transkription
was ist Prä-initiationskomplex? TFIIA, B, D, E, F, H bilden Prä ik
TBP Bindet an TATA-Box, verbiegt die DNA, wird bei Pol II immer benötigt, ist UE von TFIID, binden in der kleine Furche
Spezifische TF? sind nicht in allen Zellen oder zu jeder zeit vorhanden.Binden außerhalb des Promoter Bereich an die DNA.Aktivieren oder hemmen bestimmte Gene, wie Proteine die an Enhancer binden.Egal b sie an DNA binden oder nicht.sie regulieren die Transkription
Enhancer? Reguliert gewebespezifisch Gene, liegen teilweise entfernt vom Gen, können vor oder hinder dem Gen liegen,hier binden viele Proteiene wie Aktivatoren Repressoren, zus bilden sie Enhanseosom. Wirkung erfolgt über die Bindung an die DNA.
Enhanseosom im Enhancer Bereich der DNA kommen viele Proteine zusammen bilden das Enhanseosom, biegen dabei die DNA, damit Enhanser zum Promoter kommt, der aktiviert od repremiert wird
S/MARs und Insolatoren? S/Mars ist die Sequenz, Insolatoren sind die Proteine die dran binden, Insolator Reg ist Struktur konserviert nicht Sequenz, Wirken Richtung unabhängig, können alle Gene in sein Loop kontr.
können Enhancer auch runterregulieren? ja sie heißen dann Sinencer
wie wird der Wirkungsbereich des Enhancers begrenzt? Durch Insulatorregion (boundary Elemente), Die Loopsknoten bilden
wie wird die bewegung des Enhandser zum Promoter bewirkt? Mediatorkomplex, aus ca. 20 UE (Proteine)
was ist der Unterschied zw der Proteine des Enhanseosoms und Mediatorkomplexes? Proteine des Enhansers binden an DNA, des Mediatorkomplexes nicht, können aber kurzzeitig an die DNA binden.
interagiert Mediatorkomplex mit Pol II? ja
Locus Kontrollregion LCR? Unterschiedliche Startpunkt der Transkription wird reguliert bie betaglobin. ist 15000bp Region. LCR liegen viele Tausend Basenpaare vom Transkriptionsstart entfernt und bestehen aus DNase I-sensiblen Regionen
was ist der Unterschied zw LCR und Enhancer? Enhancer Richtung unabhängig, LCR Richtung abhängig
Created by: sh2013
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