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GeneXpress 03C
Transkription Euk
| Question | Answer |
|---|---|
| Enhancer | außerhalb des Promotors und häufig weiter entfernt liegende regulatorische Sequenz, an die TF binden |
| Initator Box | Initiatorsquenz am Startpunkt der Transkription bei Euk. |
| TBP | TATA bining protein, Bestandteil des TFIID, der die TATA-Box erkennt |
| TATA-Box | Bindestelle für einen TF, der bei Euk. die RNA-Pol 2 zum Promotor leitet ( Anhand TATA Boxer kennt Pol 2 den Promotor) |
| Upstream Element | Upstream Promotor Element; in Eukyotoschen Promotoren stromaufwärts von der TATA-Box (vor TATAbox) gelegene DNA- Seq. die von bestimmten Proteinen erkannt wird, ein Promotor kann mehrerer UE enthalten.UE sind spez. TF |
| Promoto bei Eukaryoten für Pol 2 | BRE--TATA--INR---DPE |
| was pasiert bevor RNA Pol bindet | TFIID (enthät auch TBP) bindet an TATAbox-> TFIIA und TFIIB binden(bilden Initiationskomplex) ->TFIIF bindet, kann DNA-Helix entwinden-> Pol 2 bindet |
| was passiert wenn Pol 2 bindet | damit Pol 2 von den Promtor gelöst wird und weiter laufen kann, kommen andere TF2 dazu, wie TFIIE TFIIH TFIIJ |
| was ist +1 Postion | Stelle des Transkriptionsstarts-> also 1. Base der RNA |
| Downstrean? | Transkription verläuft in 5' → 3' Richtung-> „Downstream“, in 3'-Richtung |
| Upstream? | Alles was vor +1 (also in Richtung Promoter liegt)-> „Upstream“, in 5'- Richtung |
| wie lange bleibt die RNA Pol am Promotor? | bis 8-9bp transkribiert wurden sind |
| TFII sind spez-oder allg. TF? | TFII sind allgemeine TF, weil sie immer erforderlich sind |
| Promoter-proximales Pausieren? | bei ca. 30-40Nukleotiden pause der Pol II. |
| Wie wird das 5' Cap angefügt | in 3 Schritten, nach 20-30 Nukleotide RNA. 1.ein P von Triphosphat vom Nukleotid am 5'-Ende wird entfernt 2.ein GMP wird durch Guanyltransferase angehängt 3.wird dieses G durch Guanin-7-methyl- transferase methyliert |
| warum wird 5' Capping gemacht | 1.damit die Trank überhaupt weiter läuft,2.hier binden Proteine, die die mRNA ins Cytoplasma transportieren (ohne Cap kein Transp), 3.wichtig für Initiation der Translation,4.Schützt mRNA vor Abbau durch 5'-3'-RNA Nukleasen |
| Was sind CTDs? | carboxy-terminal-domain:repititive Region am C-terminalen Ende der RNA-Pol II, wird phosphoryliert, Interaktionspartner mit Capping |
| bei welchen RNAs findet keine Capping statt, warum? | rRNA und tRNA, Pol 1 und 3 habe keine CTD, die Cap erkennen, rRNA und tRNA haben kein Cap |
| CTD Posphorylierung? | Phosphorylierung des 5. Serin dann 2.serin im Hepta-Repeat erfolgt, wenn RNA Polymerase Promoter verlässt. |
| Terminator? | DNA- Seq am Ende eines Genes, die der RNA Pol das Signal zum beenden der Transk. gibt |
| was bewirkt Terminator Seq bei mRNA? | Auf mRNA bildet er Hairpin Struktur aus, sind inverted repeats |
| Wo sind mRNAs Polyadenylierung? | 3' Enden (fast) aller eukaryotischen mRNAs sind polyadenyliert. |
| mRNAs Polyadenylierung wie? | Pol läuft über das Polyadenylierungssigna (AAUAA)hinweg->in bestimmten Abstand dazu wird geschnitten->Es wird ein ca. 200 Adenosinen (PolyA-Schwanz) mit PolyA-Polymerase an das 3'OH-Ende der mRNA gegehängt |
| Was bedeutet Promoter clearance? | wenn bia ca. 9 nt erfolgreich synthetisiert weden, intiationsfakt werden gelockert, sigma geht ab, Pol ändert die Konformation und bindet fester an DNA |
| was ist der Unterschied zw Pro und Euk nach Promoter clearance? | Bei Prok kann Pol weiter laufen und nt synth. Bei Euk findet noch Capping statt |
| Unterschied Trnaskriptionale Pausing (TP)und Transitional Arrest(TA)? | TP: Pause der Pol, wenn nt fehlen oder Nucleosom erst verschoben werden muss.TA: wenn weitere Elongationsfaktoren benötigt werden, damit Pol weiterlaufen kann, z.b. ein Stück RNA wird abgebaut und dann wieder neu angefangen |
| Unterschied Polyadenylierung beo Prok und Euk? | Euk: Der Poly(A)-Schwanz wird von dem Poly(A)-Bindeprotein (PABP) besetzt und ist notwendig für die Initiation der Translation, mRNA wird nicht abgebaut. Prok: PolyA ist signal für Abbau |
| was sind posttranskriptionale Modifikationen der Prä-mRNA(hnRNA)? | Spleißing, PolyA, Capping, RNA Editing |
| welche RNA haben Introns? | tRNA, mRNA, rRNA,miRNA |
| Gruppe 1 und 2 Inrons, wo gibt es die? | Gr1: bei niederen Euk,Selbst spleißing (Autokatalytische RNA), braucht freies Guanosin. Gr2: bei einigen Pilzen(Hefe),Organellen von Pflanzen und Bakterien,über Lassostruktur |
| spleiseosom? | Komplex aus snRNA und assoziierten Proteine |
| Was sind snURP (snurps)? | sind Ribonucleoproteinkomplexe, U1, U2..U6 |
| Aufbau mRNA exon intron..? | 5'--Exon1--GU--Intron--Asite--Pyrimidin reich Reg-AG--Exon2-- |
| Splicing? | U binden an GU-> lassostruktur zu A (banchpoint)->andere U ab AG wird getrennt-> exon1 und 2 werden zusammengefügt |
| was sind Donor Akzeptor bei Splicing? | GU Donor AG Akzeptor |
| wo findet keine Basenpaarung bei Splicing? | zw snU2 und A (branchpoint), Basenpaarung bei Us mot GU und AG |
| was ist das Interaktionspartner für Spleiseosom? | A (Branchpoint) |
| wie viele Speißarten? | normal: Introns entfernen trans:Exons von unterschiedlichen Genen werden zusammengefügt (verschied mRNAs) alternative: Exons werden anders kombiniert, aus eine hnRNA werden viele mRNAs |
| Varianten des alternativen Spleicing? | sind Zellspezifisch 1.Exon Kassetten Selektion 2.Promoter Selektion 3.Tail Site Selektion |
| prozentual, wie viele vn Menschen Gene werden alternativ gespleißt? | 60% |
| wie wird die richtige Splicing Site erkannt? | alternative splicing oft abhängig von Zelltyp und Stadium Sites werden schon während der Transkription duch Faktoren markiert Erkennung durch regulative RNA, wie intronische oder exonische silencer oder Enhancer |
| RNA Editting? Welche RNAs beteiligt | Veränderung einzelne Base in mRNA,erhöht die Diversität und Proteinvielfallt,Basen werden eingefügt oder entfernt, z. B. Deaminierung von Cytidin zu Uridin; ◦ Deaminierung von Adenosin zu Inosin; gRNA (guide RNA) sind beteiligt |
| wie wird mRNA ins Cytoplasma transportiert? | mit Exportkomplexen, braucht Cap und PoyA, werden jedoch von PolyA aktiviert. mRNAs haben Lokalisierungselemente an 3' für Cytoplasma |
Created by:
sh2013
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