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Enzymtechnologie

QuestionAnswer
Was bedeutet heterologe Genexpression?
Welche funktionellen Eigenschaften muss ein Expressionsvektor besitzen?
Wie sieht die Promotorregion in Bacteria aus?
Welche Arten der Genregulation sind Ihnen bekannt? Welche davon spielen im lac-Operon von E.coli eine Rolle?
Skizzieren Sie die Gensequenz vom lac-Operon
Welche Reaktion katalysiert das Genprodukt von lacZ? Zeichnen Sie die Substrat und Produkt der Reaktion.
Welche Rolle spielt IPTG bei der Genregulation in E.coli? (Wofür steht die Abkürzung? Strukturformel?)
Was ist die Shine-Dalgarnosequenz?
Nennen Sie typische Stratcodons (Häufigkeit in %) und Stoppcodons.
Welches sind die am häufigsten verwendeten mikrobiellen Expressionswirte? Nennen sie jeweils Vor- und Nachteile.
Beschreiben Sie die Funktionsweise des T7-RNA-Polymerase-abhängigen Expressionssystems in E.coli BL21 (DE3).
Was versteht man unter "codon usage" und welche Rolle spielt es bei der heterologen Expression?
An welchen Stellen kann die heterologie Expression limitiert werden?
Was versteht man unter "directed evolution"?
Was versteht man unter "rational protein design"?
Welche Voraussetzungen müssen vorliegen, um DE/RPD zur Optimierung eines Enzyms einzusetzen?
Nennen Sie Vor- und Nachteile von DE/RPD.
Welche Mutagenesemethoden werden bei DE/RPD benutzt?
Bei welchen Fragestellungen würde man DE oder RPD verwenden?
Welches Verfahren würden Sie anwenden, wenn Sie a) die katalytisch aktiven AS-Seitenketten eines Enzyms identifizieren möchten? b) das Enzym thermostabiler machen wollen?
Beschreiben Sie die allgemeine Vorgehensweise bei einem DE-Experiment
Wie kann man die Funktion eines Proteins mit bekannter Sequenz nachweisen?
Warum wird bei der Quikchange PCR der PCR-Ansatz mit DpnI verdaut?
Wie drückt man quantitativ die Enantiomerenreinheit einer chiralen Verbindung aus? Bitte geben Sie die Formel an, die von der Konzentration der einzelnen Enantiomere ausgeht.
Chirale Verbindungen kann man aus dem "chiral pool" gewinnen. Nennen Sie 3 Beispiele (aus verschiedenen Stoffgruppen) für Ausgangsverbindungen, die aus dem "chiral pool" stammen.
Einige L-Aminosäuren werden industriell durch Racematspaltung gewonnen. Skizzieren Sie bitte eine Möglichkeit zur Herstellung enantiomerenreiner AS durch Racematspaltung unter Nutzung eines Enzyms (möglichst mit Formeln).
Bei der Synthese chiraler Verbindungen mithilfe von Dehydrogenasen muss das NADH regeneriert werden. Nennen Sie 2 Beispiele für die Regenerierung von NAD(P)H.
Was versteht man unter "asymmetrischer Synthese"? (Beispiel und Formel)
Welche biochemischen Reaktion nutzt die Zelle um NAD zu regenerieren? a) aerob b) anaerob
Womit befasst sich die Proteomik?
Nennen Sie Beispiele für posttranslationale Modifikationen von Proteinen.
Was sind die Ziele der Proteomik?
Nennen Sie die Analysemethoden, die in der Proteomic eingesetzt werden.
Skizzieren Sie grob den Ablauf einer Untersuchung eines Proteoms.
Was passiert bei der Isoelektrofokussierung?
Wie trennt man Proteine praktisch nach ihrem Molekulargewicht auf?
Wofür steht die Abkürzung "SDS"? Zeichnen Sie bitte die Strukturformel.
welche Färbemethoden für Proteingele kennen Sie? Nennen Sie bitte die Nachweisgrenze und beschreiben Sie kurz die Funktionsweise.
Wie kann man nach einer 2D SDS-PAGE das ausgeschnittene Protein identifizieren? Nennen und beschreiben Sie bitte die Ihnen bekannte Vorgehensweise.
Was versteht man unter dem Begriff "OMICS"? Nennen Sie die molekularmethodischen Methoden die zum Einsatz kommen.
Beschreiben Sie stichpunktartig die Methode zur DNA-Sequenzierung nach Sanger. Mit welcher Methode wird heutzutage DNA Sequenziert? Bitte beschreiben Sie das Prinzip der Methode.
Definieren Sie den Begriff "Metagenomics". Was ist das besondere an dieser Disziplin?
Welche chromatographischen Methoden zur Proteinaufreinigung sind Ihnen bekannt? Nach welche Eigenschaften werden die Proteine jeweils aufgetrennt?
Wie groß ist eine Bakterienzelle?
Beschreiben Sie die Konstruktion eines phylogenetischen Stammbaums angefangen von der Reinkultur im Labor.
Warum ist die rRNA als evolutionärer Zeitmesser geeignet?
Wofür steht die Einheit "Svedberg"?
Welche Beweise für die Endosymbiontentheorie sind Ihnen bekannt?
Skizzieren Sie den Stammbaum der drei Domänen des Lebens.
Nennen Sie wichtige Unterscheidungsmerkmale zwischen Bacteria, Archaea und Eucaria.
Worin unterscheiden sich die Zellwände und die Zellmembranen der Archaea gegnüber der bakteriellen?
Created by: panda88
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