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Enzymtechnologie
| Question | Answer |
|---|---|
| Was bedeutet heterologe Genexpression? | |
| Welche funktionellen Eigenschaften muss ein Expressionsvektor besitzen? | |
| Wie sieht die Promotorregion in Bacteria aus? | |
| Welche Arten der Genregulation sind Ihnen bekannt? Welche davon spielen im lac-Operon von E.coli eine Rolle? | |
| Skizzieren Sie die Gensequenz vom lac-Operon | |
| Welche Reaktion katalysiert das Genprodukt von lacZ? Zeichnen Sie die Substrat und Produkt der Reaktion. | |
| Welche Rolle spielt IPTG bei der Genregulation in E.coli? (Wofür steht die Abkürzung? Strukturformel?) | |
| Was ist die Shine-Dalgarnosequenz? | |
| Nennen Sie typische Stratcodons (Häufigkeit in %) und Stoppcodons. | |
| Welches sind die am häufigsten verwendeten mikrobiellen Expressionswirte? Nennen sie jeweils Vor- und Nachteile. | |
| Beschreiben Sie die Funktionsweise des T7-RNA-Polymerase-abhängigen Expressionssystems in E.coli BL21 (DE3). | |
| Was versteht man unter "codon usage" und welche Rolle spielt es bei der heterologen Expression? | |
| An welchen Stellen kann die heterologie Expression limitiert werden? | |
| Was versteht man unter "directed evolution"? | |
| Was versteht man unter "rational protein design"? | |
| Welche Voraussetzungen müssen vorliegen, um DE/RPD zur Optimierung eines Enzyms einzusetzen? | |
| Nennen Sie Vor- und Nachteile von DE/RPD. | |
| Welche Mutagenesemethoden werden bei DE/RPD benutzt? | |
| Bei welchen Fragestellungen würde man DE oder RPD verwenden? | |
| Welches Verfahren würden Sie anwenden, wenn Sie a) die katalytisch aktiven AS-Seitenketten eines Enzyms identifizieren möchten? b) das Enzym thermostabiler machen wollen? | |
| Beschreiben Sie die allgemeine Vorgehensweise bei einem DE-Experiment | |
| Wie kann man die Funktion eines Proteins mit bekannter Sequenz nachweisen? | |
| Warum wird bei der Quikchange PCR der PCR-Ansatz mit DpnI verdaut? | |
| Wie drückt man quantitativ die Enantiomerenreinheit einer chiralen Verbindung aus? Bitte geben Sie die Formel an, die von der Konzentration der einzelnen Enantiomere ausgeht. | |
| Chirale Verbindungen kann man aus dem "chiral pool" gewinnen. Nennen Sie 3 Beispiele (aus verschiedenen Stoffgruppen) für Ausgangsverbindungen, die aus dem "chiral pool" stammen. | |
| Einige L-Aminosäuren werden industriell durch Racematspaltung gewonnen. Skizzieren Sie bitte eine Möglichkeit zur Herstellung enantiomerenreiner AS durch Racematspaltung unter Nutzung eines Enzyms (möglichst mit Formeln). | |
| Bei der Synthese chiraler Verbindungen mithilfe von Dehydrogenasen muss das NADH regeneriert werden. Nennen Sie 2 Beispiele für die Regenerierung von NAD(P)H. | |
| Was versteht man unter "asymmetrischer Synthese"? (Beispiel und Formel) | |
| Welche biochemischen Reaktion nutzt die Zelle um NAD zu regenerieren? a) aerob b) anaerob | |
| Womit befasst sich die Proteomik? | |
| Nennen Sie Beispiele für posttranslationale Modifikationen von Proteinen. | |
| Was sind die Ziele der Proteomik? | |
| Nennen Sie die Analysemethoden, die in der Proteomic eingesetzt werden. | |
| Skizzieren Sie grob den Ablauf einer Untersuchung eines Proteoms. | |
| Was passiert bei der Isoelektrofokussierung? | |
| Wie trennt man Proteine praktisch nach ihrem Molekulargewicht auf? | |
| Wofür steht die Abkürzung "SDS"? Zeichnen Sie bitte die Strukturformel. | |
| welche Färbemethoden für Proteingele kennen Sie? Nennen Sie bitte die Nachweisgrenze und beschreiben Sie kurz die Funktionsweise. | |
| Wie kann man nach einer 2D SDS-PAGE das ausgeschnittene Protein identifizieren? Nennen und beschreiben Sie bitte die Ihnen bekannte Vorgehensweise. | |
| Was versteht man unter dem Begriff "OMICS"? Nennen Sie die molekularmethodischen Methoden die zum Einsatz kommen. | |
| Beschreiben Sie stichpunktartig die Methode zur DNA-Sequenzierung nach Sanger. Mit welcher Methode wird heutzutage DNA Sequenziert? Bitte beschreiben Sie das Prinzip der Methode. | |
| Definieren Sie den Begriff "Metagenomics". Was ist das besondere an dieser Disziplin? | |
| Welche chromatographischen Methoden zur Proteinaufreinigung sind Ihnen bekannt? Nach welche Eigenschaften werden die Proteine jeweils aufgetrennt? | |
| Wie groß ist eine Bakterienzelle? | |
| Beschreiben Sie die Konstruktion eines phylogenetischen Stammbaums angefangen von der Reinkultur im Labor. | |
| Warum ist die rRNA als evolutionärer Zeitmesser geeignet? | |
| Wofür steht die Einheit "Svedberg"? | |
| Welche Beweise für die Endosymbiontentheorie sind Ihnen bekannt? | |
| Skizzieren Sie den Stammbaum der drei Domänen des Lebens. | |
| Nennen Sie wichtige Unterscheidungsmerkmale zwischen Bacteria, Archaea und Eucaria. | |
| Worin unterscheiden sich die Zellwände und die Zellmembranen der Archaea gegnüber der bakteriellen? |