click below
click below
Normal Size Small Size show me how
מבני 064238
מבנה ותכונות חומרים ביולוגים 064238
Term | Definition |
---|---|
104.45 | זווית ממוצעת של מולקולת מים |
0.96 A | אורך קשר חמצן מימן במולקולת מים |
6.2e-30 C*m | מומנט הדיפול במים |
4 | מספר קשרי המימן המקסימאלי במים |
1.86 A | בקשר מימן (במים) מרחק בין מימן לחמצן |
2.76 A | בקשר מימן בקרח המרחק בין חמצן לחמצן |
Hexagonal ice | מספר מבנים טאדרלים שמתחברים. קרח נורמלי |
cubic ice 1C | צורון מטה סטבילי של קרח. נוצר כתוצאה מדחיסת אדי מים בטמפרטורות נמוכות (מינוס שמונים מעלות צלזיוס) . יחזור להיות הקסגונאלי. מסודר בצורת FCC |
FCC | face centered cubic האטומים מסודרים בפינות ובמרכזים של כל אחת מששת הפיאות של הקובייה |
cubic ice ten (ice X) | נוצר בלחץ מאוד גבוה של מעל ל-10e11 קשרי החמצן מתכווצים, המולקולות הרבה יותר צפופות והפוטונים נמצאים במרחקים שווים. צפיפותו 2.51-2.785 גרם לסנטימטר מעוקב. מבנה של BCC. |
BCC | body centered cubic אטומים משובצים בפינות של כל פאה ואטום אחד במרכז. |
3.984 | הטמפרטורה בה מתקבלת הצפיפות המקסימלית של המים |
10e-12 שניות | אורך חיים של קשר מימן |
clusters | מבנה הנוצר כשכמה מולקולות מים מתחברות בניהן בקשרי מימן. |
אוקטמרים | חיבור של כמה קלסטרים קטנים של מים. |
icosahedral cluster | 280מולקולות מים יוצרות מבנה זה. פועל לפי מודל הצברים המהבהבים. |
מודל הצברים המהבהבים | מולקולות מים יוצרות צברים שנוצרים ונעלמים במהירות. למבנים יש יכולת לעבור ממצב דחוס לפתוח (דמוי הבהוב). עם עליית הטמפרטורה הצברים קטנים (בממוצע) ומשך חייהם מתקצר. |
surface/vicinal water | מים בקרבת משטח. מאופיינים בדרגת סדר גבוהה יותר. תכונותיהם קצת שונות ומשפיעות על אינטרקציות בין חלבונים, פולימרים ותמיסות. רוב המים במערכות ביולוגיות הם כאלה. |
kosmotrope | קוסמוטרופים- יוצרי סדר. בדר"כ בעלי צפיפות מטען גבוהה. יוצרים אינטרקציות חזקות יותר עם המים בהשוואה לאינטרציות מים-מים. |
chaotrope | כיאוטרופים- יוצרי באלגן. בדר"כ בעלי צפיפות מטען נמוכה ופולריזביליות גבוהה. |
anhydrobiosis | תופעה המתארת השרדות בתנאי יובש וחזרה לחיים מלאים כשיש מים. הסוכרים תורמים ליציבות חלבונים ובכך מאפשרים את התופעה. |
cryoprotectors | סוכרים מגנים על חלבונים ומולקולות ביולוגיות בפני קיפאון או טטמפרטורות גבוהות. |
PNIPA | מולקולת מודל המורכבת מקבוצות אמידיות ומקבוצות הידרופוביות. מאפשר ללמוד על תכונות של חלבונים. שוקע כשמחממים אותו. |
מספר הידרטציה | מספר מולקולות המים המרכיבות את הקלסטר שעוטף מולקולת סוכר. |
מוטרוטציה | סוכרים בסביבה מימית נסגרים למצב טבעת ונפתחים בש"מ.נוצרים אחד משני איזומרים אלפא (אקסיאלי) או בטא (אקווטוריאלי). |
isentropic compressibility | מקדם הדחיסות של חומרים. נמדד באמצעות התקדמות גלי קול בתווך ומדידת צפיפות התווך. |
MD | דינמיקה מולקולרית, מציאת קשר בין מספר קשרים של הסוכר עם המים כתלות בסוג הסוכר. |
radial distribution | עבור אטום- בוחנים את המרחקים שלו מכל העצמים הסובבים אותו 360 מעלות. קובעים את שכיחות האטומים מהסוגים הנמצאים סביבו. |
Ks app | פרמטר הקשור ליכולת ההידרטציה בתמיסה. יותר סדר יהיה יותר דחוס. סוכר ומלח קוסמוטרופי יתנו ערך שלילי וכאוטרופי יתן ערך חיובי. |
cloud point | הנקודה בה מתקבלת עכירות כתוצאה משקיעת הPNIPA. |
tamplate אפקט | מדבר על היכולת של מולקולות המיים להסתדר סביב איזומרים שונים של סוכר. ככל שיותר מסודר ככה מספר ההידרטציה יהיה גבוה יותר כתוצאה מהידרטציה קואופרטיבית. |
DSC | מכשיר שבו מחזיקים תמיסה אחת ומחממים אותה כך שאפשר לבדוק אם נקלט או נפלט חום בתהליך. |
Kd | קבוע שמתאר את ההגנה של הסוכר על החלבון מפני דנטורציה. מאפשר השפעה בפני סוכרים שונים. יותר גדול חלבון יותר מוגן. |
דנטורציה קרה | תופעה בה חלבונים עוברים דנטורציה בטמפרטורות נמוכות |
מספר הקואורדינציה של השריג | מספר השכנים הקרוביים ביותר של למולקולה בשריג. בשריג קובייתי סכ"ה יש 6. בטטראדרלי יש 4. |
מתח פנים | האנרגיה החופשית על פני השטח. עודף האנרגיה של מולקולה הנמצאת בפני השטח ליחידת שטח. |
חומר פעיל שטח | חומר שמעדיף להיות בפני השטח ולא בתוך הבאלק. |
Interfacial Tension מתח בין-פנים | המתח הנוצר בין שני נוזלים שלא מתערבבים בניהם. |
אדהזיה | הדבקה. כאשר מדובר על שני חומרים שונים שיש ביניהם משיכה שגורמת להם להידבק אחד לשני. |
קוהזיה | לכידות. כאשר מדובר על חומר אחד. המשיכה בין המולקולות גורמת להן להיות מלוכדות (היווצרות טיפת מים). |
אנרגיית ההדבקה | העבודה שצריך להשקיע בשביל להפריד שני חומרים שצמודים זה לזה. |
contact angel = זווית המגע | הזווית בתוך הנוזל, בין המשיק לטיפה לבין המשטח בנקודת המגע. |
לציטין | חומר פעיל שטח. ניתן להוסיף לאבקת קקאו כדי לשפר את הרטבתה |
חוק הכלים השלובים | גובה פני נוזל בכלים שלובים ישאף להיות שווה |
אגלומרציה | מרססים את קוביית האבקה (כמו קוביות סוכר) בחומר שידביק את הגרגירים ובכך יוצרים "גוש פורוזיבי" |
Ostwald ripening | תופעה המתארת מצב בו יש שני פוטנצאלים גבוה ונמוך- מעבר החומר יהיה מהגבוה לנמוך (מטיפה קטנה לטיפה גדולה)- גדילת גבישים גדולים על חשבון קטנים בטמפרטורה קבועה. |
סופר סטורציה | כמה צריך לעבור מעבר לנקודת שיווי המשקל כדי להתחיל את מעבר הפאזה |
נוקלאציה ראשונית | מצב בו עוד אין אף חומר במצב של הפאזה החדשה וצריך להתחיל להיווצר הגרעין. יכול להיות הומוגני או הטרוגני |
נוקלאציה הומוגנית | כאשר החומר המתגבש יוצר את גרעין הגיבוש בעצמו, בלי שום עזרה |
נוקלאציה הטרגונית | יש חומר נוסף שמעורב בהתגבשות. למשל פיזור של יודיד הכסף כדי לעודד יצירת גשם. |
נוקלאציה משנית | מתחילים להיווצר מוקדי גיבוש חדשים על פני הגבישים הקיימים |
Seeding | זירוז תהליך הגיבוש על ידי פיזור גרגרים המהווים מרכזי גיבוש שנוח מאוד להתגבש על פניהם ולמעשה מאפשרים להתגבר על המחסום האנרגטי הדרוש להיווצרות הראשונית של הגביש. |
cohesion energy | הקשרים שנוצרים בהתגבשות משחררים אנרגיה (חום) ומעודדים את המשך ההתגבשות |
Induction time | שיטה למדידת נוקלאציה על ידי הבחנה (בעין או במיקרוסקופ) בגביש הראשון שנוצר. לא מדוייק. |
Cryosurgery | הקפאת אזור בגוף ואז יש הרס של הרקמה והרבה יותר קל להסיר יבלות למשל |
arrested state | מעל ריכוז מסוים של סוכר תהליך הקריסטליזציה מופסק |
מצב זכוכיתי | מוצק אמורפי שנוצר כתוצאה מחוסר יכולת להסתדר בצורה מסודרת בגלל קירור מהיר מדי או ריכוז גבוה מדי. |
הנקודה האוטקטית | הגבול בין ההקפאה לבין גבול המסיסות של הסוכר. מתחתיה כל החומר הופך למוצק |
Tg’ | טמפרטורת המעבר הזכוכיתי של התמיסה הכי מרוכזת שאשר להגיע אליה ( Cg’ ) כשעושים קירור מאוד איטי. |
פלסטיסייזרים | חומרים שמורידים את טמפרטורת המעבר הזכוכיתי |
DSC | Differential Scanning Calorimetry Tg שיטה לקביעת |
מולקולה אמפיפילית | בעלת חלק הידרופילי (בדר"כ מסומן כראש) וחלק הידרופובי (הזנב) ובניהם קשר קוולנטי. |
מיצלה | המבנה הפשוט ביותר של התארגנות עצמית. חייב לעמוד בכמה קריטריונים. האזורים ההידרופובים נמצאים בתוך הליבה ומוגנים ע"י הראשים ההידרופילים. |
ליפוזומים | חלק ממערכת המרה. ממברנה עגולה שהיא דו שכבה כאשר בתוכה ומחוצה לה יש מים. יכול להיות ויסקולה או שלפוחית |
מערכת קולואידית | בנויה משתי פאזות לפחות, אחת רציפה והשנייה רציפה או בדידה. לפחות מימד אחד צריך להיות בסדר גודל של ננומטרים עד מיקרונים בודדים. |
מולקולות צוויטריוניות | מטען כולל אפס אך עדיין מכילות מטענים ולכן יוכלו למשוך מטענים מנוגדים. |
CMC | critical micelle concentration מעל ריכוז זה המולקולות כבר לא מורידות את מתח הפנים . הן נכנסות לבאלק ומתחילות להתארגן במבנים מסודרים. ריכוז אגרגטים קריטי. |
עודף השטח | כמות החומר הפעיל שטח הספוחה ליחידת שטח. נותן אינדיקציה לאינטרקציות בין האינטרפייס לבאלק. |
מספר אגרגציה | מספר המונומרים שיש בכל חלקיק (לדוגמא במיצלה). |
פרמטר המארז P | מספר חסר מימד התחום בין 1/3 ל-1. מסמן את היחס שבין שטח החתך ההידרופובי לשטח החתך ההידרופילי (בין הזנב לראש). |
worm-like או thread-like | בעלי פרמטר מארז בערך חצי. גורמים להעלאת הצמיגות. תכונות דומות לפולימרים- יכולים ליצור אינטרקציות בניהם. נחשב קולואידי כי הקוטר מוגבל. |
sponge phase | מערכת קולואידית רציפה בתמיסה. המערכת הזו נקראת דו-רציפה, יש רצף גם לממברנות וגם לתעלות המים. |
lyotropic liquid crystals | גביש נוזלי. מערכת שאבני הבניין שלה יכולות להיות מסודרות ברצף מחזורי במרחב או רק בשני מימדים ואפילו במימד אחד. .lyotropic נוסף כשהסידור נעשה בתמיסה. |
פאזה למילארית | מבנה של דו-שכבה (אחת מעל השנייה). סידור חד מימדי אין סדר, הממברנה יכולה לנוע איך שהיא רוצה. יש רצף של המים אבל אין רצף של החומר. |
פאזה קובית דו-רציפה | משטחים של דו-שכבה שיש ביניהם רצף בתמיסה. יש סידור מרחבי בשלושה מימדים. מאוד צמיגה, הקשרים בין המולקולות מאוד הדוקים ותנועתם מוגבלת. מבנה דמוי ג'ל |
פאזה הקסגונאלית | מסודרת בשני מימדים והצמיגות שלה פחות גבוהה מאשר בפאזה הקובית. |
פאזה קובית לא-רציפה | אגרגטים קטנים (מיצלות) שמסודרים באיזשהי מחזוריות במרחב ויוצרים מבנה תלת מימדי. צמיגות פאזה זו גבוהה יחסית אך יותר נמוכה בהשוואה לקובית הרציפה. |
פאזה מיצלרית | ריכוז נמוך וטמפ' נמוכה. מבנה של מיצלות מפוזרות במרחב |
Beta casein | לא מכיל קשרי דיסולפיד. חלבון ללא מבנה שלישוני, אך מאחר בעל אמפיפיליות גבוהה כך שהוא מצליח להתארגן במבנים של מיצלות. |
ITC | מכשיר מאוד מדויק שמאפשר לקבל נתונים תרמודינמיים באמצעות טיטרציה איטית. |
טמפרטורת קראפט | טמפרטורה מינימאלית בה יכולה להתרחש התארגנות עצמית. מתייחסת לחומרים טעוניים שמסיסותם תלויה חזק בטמפרטורה. |
קו הCMC | מתאר את הריכוז שמתחתיו יהיו מונומרים בתמיסה ומעליו יווצרו מבנים. |
נקודת קראפט | נקודת המפגש בין קו המסיסות לקו הCMC. מתחתיה יש שיקוע, מעליה מבנים. מאפיין מערכות של חומרים טעונים. |
Hydrotropes | סוג של מלחים בעלי טבעת ארומטית הידרופובית ונפחית. משתלבת בתוך המבנים הנוצרים בתמיסה ומקנה תוספת של קשרים הידרופובים. גורמים לגידול המיצלות. |
CIP | contact ion pairs |
matching affinities | התיאוריה של קולינס הטוענת שאינטרקציות מועדפות מתקיימות בין יונים עם תכונות דומות. |
Fluid lamellar | פאזה למילארית מעל טמפ' המעבר |
Gel Phase | פאזה למילארית מתחת טמפ' המעבר |
Crystalline lamellar | פאזה למילארית, דו- שכבה מוצקה |
cloud point | הטמפרטורה הנמוכה ביותר בה מתרחשת הפרדת פאזות ומתקבלת עכירות בתמיסה. מאפיין מערכות לא יוניות. |
Stern שכבת | השכבה הקרובה ביותר לחלקיק, בה צפיפות המטענים החיוביים היא הגבוהה ביותר. |
פוטנציאל zeta | מדידת הפרש הפוטנציאלים בין פני החלקיק הטעון לבאלק. ערך זה מעיד על יציבות התמיסה. |
Debye length | מדד המייצג עד איזה מרחק מורגש המטען שיש על חלקיק. |
Small Angel X-Ray Scattering | זוהי שיטה בה מקרינים את הדוגמה בקרני x-ray ומודדים באמצעות גלאי את פיזור האור. השיטה מאפשרת לקבל מידע מבני לגבי הצורה וגודל האגרגט וגם על המבנה הפנימי שלו. |
עקומת SAXS | עוצמת הפיזור כפונקציה של וקטור הפיזור (שהינו פרופורציוני הפוך לממד האופייני של - החלקיק). |
DPPC | מערכת ליפידים בעלת שני זנבות שומניים ו- Tm=41 C |
פולימר | מקרומולקולה שבנויה מהרבה יחידות קטנות (מעל 50) חוזרות המחוברות ביניהן בקשרים קוולנטיים. |
אוליגומר | מספר קטן (3-50) של מונומרים |
הומופולימר | פולימר המורכב מיחידות חוזרות של אותו מונומר. |
הטרופולימר | פולימר המורכב מיחידות חוזרות של מונומרים שונים. |
בלוק קופולימר | פולימר בו אבני הבניין מסודרות כבלוקים. |
Alginate | מופק מאצות. זהו די-בלוק קופולימר לינארי שאינו מסועף, המורכב מ- D-mannuronic acid (M) ומ- L-guluronic acid (G) המחוברים בקשרי ביטא (1 ל-4). נבדלים זה מזה בריכוז של M ו-G. |
Carageenan | זהו פולימר שהוא alternating – המונומרים A ו- B חוזרים לסירוגין |
Core | ליבה הידרופובית |
Corona | מעטפת הידרופילית |
layer by layer | שיטה בה מספחים פולימרים אחד על השני כל פעם עם מטען נגדי. |
אמולסיה | מערכת הטרוגנית שמכילה לפחות מומס אחד שלא מסיס במים. בנוסף יש חומר בין הפאזה ההידרופילית להידרופובית שמייצב את פני השטח. 0.4 ננומטר ומעלה. |
HLB פרמטר | המבטא את התכונות ההידרופיליות והליפופיליות של חומר אמפיפילי. בעל ערך מספרי בטווח 1-20. מספר נמוך- מסיס שומן, מספר גבוה- מסיס מים. |
PIT | phase intersion temperature טמפרטורת מעבר מפאזה אחת לשנייה דרך המערכת הדו רציפה כתלות בטמפרטורת המים. |
דרגת הפולימריזציה | מספר המונומרים המרכיבים את הפולימר. - n |
תכונות קוליגטיביות | תכונות אלו כוללות את הורדת נק' הקיפאון, העלאת טמפ' הרתיחה, לחץ אדים ולחץ אוסמוטי והן תלויות במספר המולקולות. |
static light scattering | שיטת פיזור אור. שיטה רגישה למשקל המאפשרת למדוד ממוצע משקלי. |
centrifugal sedimentation | משקעים את המולקולות בעזרת צנטריפוגה בגרדיאנט ריכוזים של סוכרוז. שיטה למציאת ממוצע Z. |
אינדקס הדיספרסיה | מדד לפיזור |
Graft copolymer | בלוקים של מונומר אחד מופיעים בהסתעפויות מהשרשרת הראשית העשויה בלוק של מונומר שני. |
קונפיגורציה | המבנה הסטראוכימי של המולקולה. מבנה זה לא יכול להשתנות במעבר בין ממסים שונים. |
End to End distance | המרחק בין קצה אחד לשני של הפולימר, נקרא R |
RH | רדיוס הידרודינמי. פולימר בנוזל נע וזורם- מעוכב על ידי חיכוך. התייחסות כמן כדור סגור וקשיח שנע באותה מהירות בתמיסה. כלומר מהירות כדור אקויולנטי, שמהירותו זהה ובאותה התנגדות של תמיסה. |
Rg | מתאר את פיזור המסה סביב מרכז המולק'. זהו מדד נוסף לגודל שהפולימר תופס בתמיסה. מרחק מרכז הפולימר מהאטום. |
צעדי השיכור | מודל המתאר על תנועת הפולימר בצורה אידאלית בה אין הגבלה על הזוויות המותרות בין כל שני מונומרים. זהו כיוון אקראי. |
C∞ | מדד לקשיחות השרשרת. ערך גדול מ1. מראה כמה אילוצים יש על השרשרת. השוואה בין פולימר אמיתי במצב טטא להליכה אקראית |
מצבט טטא | מגדיר תנאים בהם האינטרקציה בין כל שני מונומרים זהה לאינטרקציה עם הממס. כלומר יש אדישות לממס ולכן מדובר בממס אדיאלי. |
excluded volume | אפקט הנפח המוכלל או הימנעות עצמית מהליכה אקראית- הנפח המגביל של חלקיק הוא נפח אליו מרכז המסה של חלקיק אחר לא יכול להיכנס. |
פקטור אלפא | פקטור התפרשות השרשרת. אפקט הממס בלבד- פריסת הפולימר בממס מסויים לעומת בטטא. |
Kuhn step | האורך הממוצע של כל וקטור המתקבל כתוצאה מהכרחת פולימר להתנהג לפי מודל השיכור. מתקבל מתוך המודל האוניברסלי. מדד לקשיחות השרשרת. |
q- persistence length | מתאר את אורך הקטע עד שההסתברות ללכת בכיוון המקורי יורדת ב- e/1 |
mesh size (קסיי) | המרחק הממוצע בין שתי שרשראות שקרובות זו לזו. מדד הופכי לריכוז התמיסה. |
הנחת השדה הממוצע | ההסתברות למצוא מונומר בתא סמוך מסויים שווה לשבר הנפח של המונומר בתמיסה. הנחת יסוד בתיאורית פלורי הגינס. |
חיי | מקדם האינטרקציה במערכת התמיסה פולימר לפי פלורי הגינס. |
ucst | הנקודה הקריטית- upper critical solution temp מעליה התמוססות ספונטנית מתחתיה סיכוי להפרדת פאזות. |
LCST | מעל העקומה נקבל שתי פאזות וכשמקררים מגיעים לפאזה אחת. |
נוזל ניוטוני | בעל צמיגות קבועה בטמפ' נתונה. מאמץ הגזירה פרופורציונלי לקצב הגזירה ומתקבל קו לינארי. |
נוזל פסאודופלסטי | צמיגותו יורדת עם העלייה בקצב גזירה |
נוזל בינגהם | נוזל בעל מאמץ כניעה yield stress . לא יתחיל לזוז לפני שנפעיל עליו מאמץ כלשהו. |
נוזל דילטנטי | צמיגותו עולה עם העלייה בקצב הגזירה |
טיקסוטרופיים | הצמיגות תרד במהלך הפעלת כוח הגזירה, אך תחזור למצב המקורי לאחר זמן מה. |
ריאופקטיים | גזירה גורמת לבניית מרקם, כלומר, לעליה בצמיגות. |
ויסקואלסטיות | תכונות אלסטיות ותכונות זרימה ביחד. קצב בין המאמץ למעוות משתנה עם הזמן. |
creaming | אם צפיפות החלקיק נמוכה מצפיפות הנוזל, הוא יצוף. דוגמא:תופעה בה שומן צף למעלה ולמטה נשאר חלב רזה. |
תרחיף | חלקיקי מוצק מפוזרים בתוך נוזל |
קצף | גז מפוזר בנוזל או במוצק |
איירוסול | טיפות נוזל מפוזרות בגז |
פלוקולציה | תהליך הפיך בו החלקיקים נצמדים זה לזה, אך כל חלקיק שומר על זהותו. |
קואגולציה | תהליך בלתי הפיך בו החלקיקים נצמדים בצפיפות זה לזה ומתחברים. |
קואלסנס )איחוי( | התלכדות של טיפות |
סינרזיס | יציאת מים כתוצאה מהתכווצות הג'ל |