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Solemne 2 Gen

Genetica y biología celular

QuestionAnswer
Hay relación entre la cantidad de genes y la complejidad del individuo? No
El ADN de cada cromosoma se ubica en una parte específica del núcleo? Si
Genoma nuclear 3.200 megabases (en el genoma haploide) o 3 gigas (3.000.000.000 pares de bases) 20.000 genes. El 38% del ADN esta asociado a genes (y de ese solo el 2% es codificante osea exones) y el 62% del ADN esta asociado a extragenico (47% altamente repetitivo)
Genoma mitocondrial 16,6 Kb 37 genes (2 genes RNAr, 22 genes RNAt,13 genes proteínas), siendo 28 cadena H (cadena pesada) y 9 cadena L (cadena liviana) 93% es codificante Es heredado de la madre
La mitocondria depende de proteínas codificadas por el genoma nuclear para garantizar sus funciones? Si, por que Los componentes proteínicos constituyentes de la cadena oxidativa son 80...pero la mitocondria codifica sólo 13 La mitocondria no exporta sus productos génicos
Por que el ADNmt es más suceptible a sufrir mutaciones? No dispone de sistemas reparación. El no está asociado a Histonas, por lo que podría estar menos protegido. El está en la matriz mitocondrial donde se produce gran cantidad de radicales libres como productos secundarios de la fosforilación oxidativa.
Cuales serian ADN no codificante? Intrones Genes de otros ARN (como el ARNt, ARNr, ARNp, snARN, snoARN) Funcionales fragmentos génicos y Pseudogenes Secuencias no traducidas (5’UTR, 3’UTR, promotores)
Que son los Pseudogenes? Son genes no funcionales. Pueden considerarse elementos resultantes de la evolución del genoma (el cual está sufriendo cambios continuamente). Productos de mutaciones) o mutaciones puntuales acumuladas, que lo hacen no funcional
Que son los fragmentos de genes? Son aquellos genes que han perdido parte de sus extremos. Genes truncados
Que son los intrones? Secuencias intragénicas no transcritas. Se encuentran entre los exones, los cuales corresponden a los segmentos del gen que si posee la información que será traducida a proteína
Que son las secuencias no traducidas Secuencias de un gen que se ubican río arriba del inicio de la transcripción: Región promotora y dentro de la secuencia transcrita, pero que no se traduce: 5’UTR y 3’ UTR
Cuales serian las funciones de los genes 23.2%: Control de la expresión, replicación y mantenimiento del genoma. 21.1%: Transducción de señales. 38.2%: Sistemas de transporte, plegamiento de proteínas, elementos estructurales. 17.5%: Funciones bioquímicas generales de la célula
Que es la transferencia horizontal? Cuando transfieres ADN sin ser su progenitor, como lo hacen algunos virus. Por ejemplo: HERV (retrovirus endógenos humanos)
Que hacen los ARN pequeños? Regulan la expresión de genes (y también hacen esto las secuencias repetidas)
Cuales serian ADN repetido disperso? LINES (elementos dispersos largos) SINES (elementos dispersos cortos) Transposones Una secuencia específica se repite n veces a lo largo del genoma en forma aparentemente aleatoria.
Cuales serian ADN repetido en tandem? DNA satélite (5- 200pb) DNA mini satélite (6- 25pb) DNA microsatélite (2 o 3 o 4 pb) Secuencias de longitud variable que se repiten en grupo.
Que son los transposones Son secuencias cortas de ADN (de 1 kb) que pueden moverse en forma independiente y crear copias adicionales de si mismos, debido a que un transposón contiene en gen de una enzima transposasa
Cuales son las 3 etapas de la purificación del ADN? Rompimiento celular, eliminación de contaminantes y concentración
Como se sintetiza el ADN? Es sintetizado al agregar nucleótidos en el extremo 3’OH, siempre en sentido 5’ → 3’
Que hace la endonucleasas de restricción? Tijeras moleculares” que cortan el ADN en secuencias específicas (reconocen patrones), rompen ácidos nucleicos (reciclas ADN)
Cuales son los dos tipos de corte de las endonucleasas? Plano (extremos romos) y escalonado o cohesivo
Que hace la ADN polimerasa? Agregan nucleotidos a una cadena a partir de una hebra molde
Que hace la ADN ligasa? Es una enzima que actúa como pegamento para unir fragmentos de ADN, uniendo los extremos de cadenas de ADN mediante la formación de enlaces fosfodiéster (une nucleotidos adyacente o que están al lado). Unen los extremos corregidos, dejandolas continuas
Como se puede visualizar una electroforesis? Colorante bromuro de etidio (emite fluorecencia cuando se le pone luz ultravioleta) Marcaje radioactivo (P32), antes de la electroforesis Colorante no tóxico como Red-Gel, SYBR® Safe o Green gel Tinción azul (no se une al ADN)
Cuales son los pasos de la electroforesis? Preparar el gel de agarosa Prepara la muestra Sembrar la muestra en el gel Correr el gel Visualizar el gel
Para que sirve la hibridación de los acidos nucleicos y como se hace? Detectar y localizar secuencias de ADN o ARN específicas en el laboratorio Se realiza desnaturalizando un ácido nucleico (separando sus hebras) y luego permitiendo que una cadena complementaria (sonda) se aparea con él.
Cuales son los 3 tipos de sondas calientes? Fragmentos de DNA - Fragmentos de RNA - Oligonucleótidos sintéticos u oligosondas. Son radioactivas
Cuales son los tipos de sondas frias? Enzimas Marcadores de afinidad Moleculas quimioluminicente No son radioactivas (son más seguras)
Que es la inmunohistoquimica? Es detectar proteinas con anticuerpos
De que es la membrana del Southern Blot? Membrana de nitrocelulosa (y despues se le pone nova)
Para que sirve el western Blot? Es la prueba definitiva de que una proteina si se expresa o si se expresa más o menos
Que hace el SDS-PAGE? Desarmar todos los puentes sulfuro, por polipeptido de proteinas (en condiciones desnaturante
Que es lo que busca el PCR y cuales son sus etapas? Es la amplificación de DNA in vitro por medio de la polimerización en cadena de ADN El propósito del PCR es hacer muchas copias de un fragmento de DNA (cant exponencial) Desnaturación a 94°C Alineamiento a 54°C Extensión a 72°C
Cuales son los tipos de PCR? PCR cuantitativa (qPCR) RT-PCR PCR multiplex (mPCR) PCR en tiempo real (con un reportero flourecente)
Secuanciación método sanger Se utiliza DNApolimerasa (T7), desoxinucleótidos (uno de ellos marcado con S35), un partidor y di- desoxinucleótidos.Los fragmentos se separan en un gel de poliacrilamida y ureaEl gel se seca y se somete a autorradiografía. Se pueden leer entre 300-400
Secuanciación automatica de ADN Ello se pudo lograr con la síntesis de un set de dideoxiribonucleótidos marcados con diferentes compuestos fluorescentes Se obtienen entre 500- 1000 bases/ secuenciación
Cual es la diferencia de cant de cromosomas entre eucarionte y procarionte? En eucariontes el ADN del organismo está en múltiples cromosomas lineales. En procariontes el ADN del organismo está en un único cromosoma circular.
Cuales son las caracteristicas de la replicación en procariontes? Semiconservativo (se mantiene una hebra hija y se copia) Bidirecccional (en cada burbuja de replicación ocurre el proceso en ambas esquinas u horquillas) Simultáneo Semidiscontinuo Semiconservativo Bidirecccional
Como comienza la replicación en las celulas procariontes? Con un solo origen de replicación (1 burbuja de replicación y 2 horquillas de replicación Un origen de replicación es una zona rica en A-T, donde se unen las proteínas iniciadoras de la replicación y separan las dos hebras
Que es un cebador o partidor o primer? Es una secuencia corta de ADN (o ARN) que funciona como punto de partida para la replicación del ADN (y se usa en el PCR)
Que hace la primasa (o alfa) en la replicación del ADN? Sintetiza y agrega el cebador para que la ADN polimerasa pueda iniciar el proceso y agregar los nucleotidos . Es una enzima de tipo ARN polimerasa
Que hace la helicasa? Separa las dobles hebra al romper los puentes de H
Que hacen los single- stranded DNA binding protein (SSB)(proteina estabilizadora)? Mantiene separadas a las dos hebras (evita que se unan) durante todo el proceso
Que hace la topoisomerasa II? Enzima que separa la alfa helice de ADN y relaja la energía de separación (la descomprime o desastibiliza las 2 hebras para que despues las separe la helicasa)
Qué hace la ADN polimerasa 1 o exonucleasa? Remueve el primer y rellena el espacio dejado por el degando dNTP y repara el ADN
Que hace la ADN polimerasa 2 o exonucleasa? Repara el ADN
Que hace la ADN polimerasa 3 (o delta y epsilon)? Réplica la cadena, agrega los nucleotidos
Cómo avanza la horquilla de replicacion en eucariontes ? En un cromosoma eucarionte cada horquilla de replicación avanza en dirección opuesta a partir de un origen de replicación. Lo que lo hace más lento
Cuál es el problema de llenado de los extremos 3’? Los telómeros estabilizan a los cromosomas previniendo la pérdida genómica después de cada replicación celular y se asocian con proteínas para formar un tapón que “oculta” los extremos cromosómicos de la maquinaria celular de reparación del ADN.
Nucleolo Contiene las secuencias de DNA que codifican para rRNArepetidas cientos de veces, uno al lado del otro(en tandem)Se sintetiza un pre-RNA que luego es procesado para originarrRNA 28S y 5,8S( mayor) y 18S (menor)se ensambla.Se tiñe distinto por su cromatina
Cómo se ve la eucromatina y heterocromatina en microscopia electronica? Blanco y negro respectivamente
Donde se localiza la eucromatina y la heterocromatina? En los brazos del cromosoma en la eucromatina y en los telómeros y centromeros en la heterocromatina
Cuál es la clasificación morfológica de los cromosomas? Submetacenterico (p menor a q),metacenterico (p igual a q), telocentrico (solo q) y acrocentrico (p es mucho menor a q)p es el brazo corto (donde tiene un satélite), q es el brazo largo, tiene telómeros en los extremos de ambos brazos y un centromero
Cuales son las carecteristicas de la replicación en eucariorentes? Semiconservativo Bidirecccional Simultáneo Semidiscontinuo Secuencial La velocidad de copia es de 600 pb/min Células humanas poseen entre 10.000 y 100.000 orígenes de replicación
Cuales son las unicas celulas que despues de diferenciarse (en G0) no pueden volver al ciclo en condiciones adecuadas y en in vitro? Los eritrocitos por que no tienen nucleo
Cuales son las heterocromatina constitutiva y facultativa? La priemera es ADN repetido (no hay genes) y forma los centromeros y la segunda son genes que degaron de expresarse (no se transcribe) (como el corpusculo de bor, cromosoma X inactivo)
Que es un nucleosoma? Es la unidad básica de la cromatina, la estructura del ADN en las células eucariotas. Está formado por un segmento de ADN (146pb) enrollado alrededor de un núcleo de ocho (4 tipos y 2 de cada uno) (H2A, H28, H3, H4) proteínas llamadas histonas
De que se constituye la fibra basica? Nucleosoma (146pb) + ADN linked (54pb) =200pb
Que es la cromatina? ADN + histonas
Que es la histona H1? Es una histona que no es parte del nucleosoma. Que se une a la salida de ADN (afuera del nucleosoma), empieza a apilar los nucleosomas de a 6 (30 nanometro total). Formando la fibra solenoide (así se encuentra el ADN en el nucleo)
Que es la Sc1? Es una proteina similar a la topoisomerasa II
Que es la Sc2 o SMC2? Es una proteina nop histonica, una condensina (por ejemplo el andamio). El cual dirige el condensado del ADN, es como un esqueleto. Le da forma y dirige como se compacta la cromatina en cromosoama
Que es la secuancia SAR? (scaffold atachment region) ricas en A/T, dispersas en genoma, flanquean genes y a menudo se asocian con sitios ORI
Que es un cariotipo? Número, tamaño y forma de los cromosomas. Y cada especie tiene su cariotipo
Que es un centromero? Es la contricción primaria (estrechamiento), familia alfoide (DNA satélite alfa, de 170 pb, forma repetidos en tándem, se repite 1.700 a 29.000 veces, abarcando de 300 a 5.000 Kb. Varía en cada cromosoma. A partir de este están los brazos
Cual es la contricción secundaria? El satelite en el brazo P
Que pasa al final en el telomero? Al final queda un ADN de hebra simple que da un vuelta y se mete en las 2 hebras. El cual sella y protege el ADN. Evita que las endonucleasas lo reconosca y asi no lo degradan
Que es un telomero (TTAGGG)n repetido en tandem de 2 a 15 Kb en los extremos
Cuales son las regiones subtelomericas? DISTAL Secuencias cortas comunes a varios cromosomas 95% homología de secuencias (TTAGGG)n degenerado PROXIMAL Secuencias largas comunes a unos pocos cromosomas
Para que sirve la colchicina? Impide polimerizar o crear tubulina, entonces no se crea el huso mitotico y la celula se queda en metafase
Cual es el bandeo C? Se tiñen los centromeros y el brazo q del cromosoma Y. Por que ambos son heterocromatina constitutiva
Cual es el bandeo N? Region organizadora del nucleolo
Cual es el bandeo G Es un codigo de barra, tiñe a lo largo del cromosoma los patrones de banda. Cada par de cromosomas tiene su patrón especifico (y poder armar el cariotipo)
Cuales son las mutaciones constitutivas? Era una mutación que ya venia de unos de los gametos de un padre (estos pueden no tenerlo y a verse producido en la meosis). Y está presente en todas las celulas
Cuales son las mutaciones adquiridas? No fue una mutación heredada sino que la anomalia ocurrio en el mismo individuo. Se presenta en mosaico. Su gravedad depende si ocurre temprano (más grave) en el desarrollo embronario o tarde o despues de que nacio
Cuales son las mutaciones numericas y estructurales? Cambio en el numero de cromosomas y cambio en la estructura del cromosoma, respectivamente
Que es una delección? Es donde se pierde info genetica. Esta la terminal, que sucede en un extremo del brazo y la interticial que sucede dentro del brazo. Hay micro o macro según cuanto genes afecta
Que es una duplicación? Es una duplicación erronea. Cuando se encuentra cualquier parte del material genético- un locus o un fragmento de un cromosoma – más de una vez en el genoma. Genera un desbalance en la cant de proteinas. Es menos grave que la delección
Que es el entrecruzamiento desigual y que provoca Cuando los cromosomas no se alinean en forma correcta. Produce duplicaciones y delecciones (o mal apariamineto de los cromosomas)
Que es una inverción? No pérdida ni ganancia de información genética, es reordenación lineal de la secuencia de un cromosoma gira un trozo y queda un orden equivocado. Esta la pericentrica el trozo gira con el centromero y paracebtrica el trozo no gira con el centromero
Que son las translocaciones? Es el intercambio de segmentos entre cromosomas no homólogos No hay pérdida o ganancia de información genética, sólo hay un reordenamiento por lo que no afecta la viabilidad del individua (no confundir con crossing over). No importa el tamaño trozo
Cuales son los 2 tipos de translocaciones? Esta el reciproco donde ambos cromosomas intercambian un trozo de ellos y el no reciproco un cromosoma da un trozo pero el otro no intercambia un trozo. Puede ser espontanea o inducida (ej rayos X)(generan quiebre cromosomicos)
Que es la translocación robercionana? Es cuando se produce una fusión (más común) y una fisión de los cromosomas. Más comun en los cromosomas 14 y 21. La portadora de esto generara 4 gameto con mutaciones distintas
Que son las euploidias? Se altera la dotación haploide (n) de cromosomas Monoploides: 1n Poliploides: Aumento del número completo de cromosomas (1-3% en humanos) (es inviable, abortos espontaneos) Triploide (3n), Tetraploide (4n), Pentaploide (5n)
Que son las aneuploidias? Implican la pérdida y/o ganancia de uno o varios cromosomas completos y puede incluir tanto a autosomas como a cromosomas sexuales Monosmía: 2n-1 Trisomía: 2n+1 Tetrasomía: 2n+2 Se puede producir por una mala disyunción
Cuales son las causas de la trisomia del par 21 (sindrome de down)? No disyunción: meiosis I (oogenesis 55%) No disyunción: meiosis II (oogenesis 20%) 25% espermatogénesis (igual proporción en cada división) Retraso anafásico Falla la incorporación de un cromosoma dentro del núcleo de la célula hija
Otras formas de ver la pregunta anterior 95% trisomía libre 4-5% translocación (14;21) 1-2% mosaico (mitosis) Se asesoran distinto La diferenica entre los fenotipos es por este mosaico
Que es la disomia uniparental? Presencia de dos copias de un cromosoma o parte de un cromosoma desde un progenitor y ninguna copia del otro. Ej de una trisomia donde se pierde uno de los cromosomas. No es ni estructural ni numerico
Como es la nomenclatura de cariotipo humano? Número total de cromosomas Colocar una “coma”(,) después del número de cromosomas Anotar el complemento de cromosomas sexuales 46,XX - 46,XY Continuar con la alteración específica, si existe 47,XX,+21 (el + es por que se agrego un cromosoma)
Que es isocromosa? Es cuando un mismo cromosoma se abre
Esto que significa (p13;q22) Translocación reciproca
Que es el ARN primario? Es la copia exacta del ADN (exones e intrones)
Que es la maduración del ARN? Agregar cap en 5' y una cola de poli A en 3' (esto lo protege de las exonucleasas) y el splising que es sacar los intrones
Que es el factor sigma? Es muy importante por que reconoce donde hay que transcribir (el sitio de union de ARN). Revisa cual parte del ADN esta abierto, se une a los promotores (rio arriba de los genes, antes del gen) y recluta todas las demas partes del complejo
Cuales son las subunidades de la ARN polimerasa? Alfa: se une a secuencia reguladoras Beta: forma los enlaces fosfodiester Beta': se une a la hebra molde Sigma: reconoce el promotor e inicia la sintesis
Más cosas sobre la ARN polimerasa El sitio de iniciación de transcripción es +1. σ se une a secuencias específicas cerca de las posiciones -10 y -35 en el promotorLas subunidades α se ubican cerca en dicción corriente arribaLas subunidades β y β ́ asocian con el sitio de inicio.
Como se lee el ADN? De 5' a 3'
Que son los codones? Son tripletes de nucleotidos que forman aminoacidos Algunos son degenerados, osea mas de un codón codifica para el mismo aa.
Cuales son los promotores procariontes? Presentan una secuencia común rica en A y T en la posición -10 (caja TATA), esta es la secuencia que reconoce específicamente la subunidad σ. A -35 se encuentra otra secuencia conservada cuyo consenso es TTGACA
Cual es una diferencia de la ARN polimerasa con la ADN polimerasa' Que la ARN polimerasa pueden iniciar la cadena
De que sirve el magnesio? Permite abrir las hebras
Cuales son los genes constitutivos? Siempre se estan transcribiendo, como el del ARN polimerasa
Que es ro independiente? La estructura de ADN molde genera una horquilla, que es una interración intramolecular (osea de la misma hebra). Donde se va a formar un puente y un lup. Esto es una barrera para que avence el ARN polimerasa (choca y se cae)
Que es ro dependiente? Es cuando no esta esta región, entonces viene la proteina RO y esta se une al complejo y frena la acción de la polimerasa (lo desestabiliza)
Que es la TATA-binding protein (TBP)? Es como el factor sigma y reconoce algo parecido a la caja 10. Es el primero en llegar
Cual es la relación entre la ARN polimerasa y los ARN? ARN pol 1 y 2: ARN estructurales ARN pol 3: ARN informales (tiene la info y codifica para proteinas)
Cuales son los ARN estructurales y que hacen? ARNr: estabiliza los ribosomas ARNt: transporta el anticodon snARNas: reguladores
Que hace la ARN polimerasa 2? Transcribe todos los genes que se traducen en proteínas
Que hace la alfa-amanitina? Inhibicion de la polimerización
Cuales son las cajas en eucariontes? -25 y -75
Que son los factores? Son parte del transcrito y son señales reguladoras
Que se hace en la elongación? La polimerización de los primeros NTPs y la fosforilación de CDT lleva a la liberación (al ser fosforilado el complejo) de TFIIB, TFIIE and TFIIH. RNA Pol II+IIF elonga la cadena, y TBP se queda en la caja TATA
Que es el spliceosoma? Es una estructura riboproteica encargada del procesamiento de los intrones
Quien pone la cola de poli A? La enzima poli A polimerasa
Que son las proteinas de intercambio? Marcan al ARNm para que estos sean exportados al citoplasma y que sean reconocidos por el poro nuclear
Quien forma al aminoacil-ARNt? La aminoacil- ARNt sintetaza
Los procesos de la traduccion necesitan factores? Si
Que hace RF1? Es capaz de interactuar con el ribosoma directamente. Ayuda a liberar las cosas y evita de otros aminoacil ARNT para la terminación
Que hacen las chaperonas? Las proteínas chaperonas ayudan al correcto plegamiento de las proteínas recién sintetizadas
Que es la estructura de la cromatina Que si la cromatina esta disponible o no, si esta como eucromatina o como heterocromatina 5 familias de complejos remodeladores de la cromatina denominadas SWI/SNF, ISWI, NURD/Mi2/CHD, INO80 y SWR1
Que es la acetilación de las histona? La acetilación nos permite desastibilizar o descompactar los nucleosomas, cromatina descompactada, transcripcionalmente activa, genes activos (se expresan. Y cuando hay desacetilación es lo contrario
Que es la regulación epigenetica? Es la herencia de patrones de expresión de genes (normal o anormal de los genes) sin que ocurran cambios en la secuencia del ADN • Modificaciones Post-traduccionales de las histonas • Metilación del ADN • Imponta
Que es la metilación de las histonas La metilación (transferido de un dador de metilos) nos permite estabilizar los nucleosoma, más compactado
Que son los dinucleotidos CPG? Son islas ricas en C y G
Cuales serian modificaciones posttraduccionales de las historias? Código de histonas: Histonas modificadas actúan como marcas para el reclutado de proteínas con funciones regulatorias Acetilación de lisinas Metilación de lisinas y argininas Fosforilación de serinas y treoninas Ubiquitinación de lisinas
Que es la formación del complejo de transcripción? Se puede ver afectada si se metila el promotor
Que hacen los proteosomas? Degrada la proteina si tiene un target de ubiquinina
Cuales son los dominios de los factores de transpcripción? Un dominio de unión al DNA, que reconoce secuencias especificas y se unen al DNA en ellas Un dominio de transactivación, que interactúa con otras proteínas y modifica la velocidad de la trasncripción
Cuales enlances o interacción que hacen estos de factores de transcripción? Hacen contacto con la doble hélice mediante: puentes de hidrógeno enlaces iónicos interacciones hidrofóbicas Por si solas, son débiles, pero el hecho de que sean múltiples hace que el complejo proteína‐DNA esté unido muy fuertemente, además de darle es
Ejemplos de Motivos estructurales encontrados en los factores de transcripción Dedos de Zinc (Zinc finger proteins) Motivo hélice-vuelta-hélice(helix-turn-helix, HTH) Basic Leucine Zipper Domain (bZIP domain)
Es verdad que una represión no significa necesariamente la represión de la transcripción? Si
Que regulación por señales tenemos? Las hormonas (y podemos tener el receptor pero no se activa)
Que es procesamiento del ARN cambia el splicing del ARNm o cambia el significado de los codones Enzima ADAR (ARN adenosina deaminasa) Reconoce el ARN de doble hebra entre el exon y el intron y se produce la edición de Adenina por Inosina
Que es la deaminación? Cambiar adesina a isodinal
Cuales son los reguladores CIS y TRANS? El priemro no son capaces de difundir a la celula y la TRANS son capaces de difundir a la cdelula y hasta a otras
El empalme con el transcrito original es una marca de degradación? Si
Cual es el ARN de interferencia Fenómeno de silenciamiento génico postranscripcional mediado por un miRNA con secuencia complementaria a un RNAm específico
Degradación de los mRNA por miRNAs (microRNA) generados a partir de genes que codifican miRNA? Enzimas clave en este proceso: Drosha (RNase III) ARNm blanco detectado por el complejo miRNA/RISC DICER (Ribonucleasa) RISC (RNA-induced silencing complex) Muchos genes de miRNAs son en realidad derivados de ARN no codificantes (intrones), que
Despues que ARNm blanco detectado por el complejo miRNA/RISC. A l apareamiento de las bases no es necesariamente exacto, al unirse puede generar represión traduccional o degradación del ARNm blanco ARNm blanco detectado por el complejomiRNA/RISC
Created by: anto22
 

 



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