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biosintesis tema 11
| Question | Answer |
|---|---|
| ORF | es el open reading frame , marco abierto de lectura , es la porcion del arnm que se lee |
| direccion de lectura del arnm | 5-3 |
| codon de inicio en euc y proc | en euc AUG procariotas AUG GUG UUG |
| donde empieza y acaba un ORF | en un codon d unicio y uno de stop |
| codon de stop | UAG UAA UGA |
| policistronicos q es ? euc o proc? | un mismo arnm codifica para varias proteinas (contiene varios genes) HAY MAS DE UN ORF procariotas |
| monocistronicos q es ? proc o euc? | un arnm codifica una unica proteina eucariotas UN UNICO ORF |
| cuantos orf hay en proc en un arm | muchos proq es policistronico |
| sitios donde se une el ribosoma al arnm como se llama | secuencias shine dalgarno o RBS ribosome binding site |
| donde se encuentra el RBS o sec shine dalgarno | al incio de cada ORF en el 5' pa q se una ahi el ribosoma y traduzca en direccion 5-3 |
| que es el acoplamiento traduccional | cuando se solapa un codon de stop con uno de inicio de dos genes contiguos |
| hay al menos -------ARNt en cada organismo | al menos 31 |
| dime 5 regiones del arn transferente | BRAZO ACEPTOR ASA U ASA VARIABLE ASA ANTICODON ASA D |
| BRAZO ACEPTOR DEL ARNT | sobresale una secuencia 3' donde se unira el aminoacido |
| asa pesudo u | porque tiene pseudouridina esta a la derecha (en el lao del brazo aceptor) |
| asa variable | entre la asa de pseudouridina y la del anticodon |
| asa anticodon | tiene el anticodon complementario al codon del arnm donde se une |
| asa D | tiene dihidrouridina |
| regiones conservadas del arnT | el extremo 3 del brazo aceptor algunos nucleotidos y el numero |
| diferencias entre los arnt que determinan que aa llevan | el anticodon la base anterior al extremo 3' aceptor ACC que se denomina DISCRIMINADOR y el tamaño del asa variable |
| que es el discriminador | es la base anterior al extremo 3' aceptor ACC que se denomina |
| cuantas estructuras teiene el arnt | secundaria (forma de trebol) terciaria(forma de L invertida tridimensional.) |
| quien comprueba que se haya unido al ARNT el aa correcto | el ribosoma no lo hace es la enzima que lo incorpora la que tiene que hacerlo bien , aminoacil arnt sintetasas |
| enzima q incorpora el aa al arnt | aminoacil ARNt sintetasa |
| pasos pa activar un aminoacido | se activa con ATP -----aa-AMP +ppi (REAC DE ADENILACION) este queda en el centro activo para unirse a ARNt cuando llegue (REAC DE TRANSFERENCIA) aa-AMP + ARN t por la (aminoacil ARNT sintetasa ) para dar aaARNt y liberar AMP |
| reaccion total que cataliza la aminoacil arnt sintetasa | AA + ARNT + ATP -------- amp y aa arnt 2pi |
| hay 2 tipos de aa arnt sintretassas porq | las de clase 1 añaden el aa al grupo 2 OH del brazo aceptor y las de clase 2 lo añaden al 3OH |
| cuantas actividades o centro activos tienen las aa arnt sintetasas | dos 1. activ sintetasa para unir el aa y arnt 2. proofreading por si se equivoca y mete el aa q no toca , hudrolia ese enlace ester |
| ribosoma eucarionte partes | 80S : sub grande 60S ( ARNr 5.8/28/5) sub peq 40S ( 18s y 33 proteins) |
| rubosoma procariota partes q | 70s sub grande 50S (arnr 5s/23s y 34 prot) sub prqueña 30S (16s/21 proteinas) |
| que reac catalizan las prot del ribosoma | PREG TRAMPA --NINGUNA!! solo actuan como andamios para que se plieguen bien las 3 moleculas de arn rib q conforman el ribosoma son prot estructurales no hacen catalisis de nada es el arn el que cataliza por eso es ribozima |
| a que consideramos ribozima y pq | al ribosoma ribozima es una enzima hecha de arn , es decir arn con activ catalitica como es el caso del ribosoma donde la activ catalitica la hace el arn rib y no las proteinas |
| que canales hay en el rib | canal de entrada de anr T y arnm y el de salida del peptido naciente |
| el peptido se pliega por completo fuera del rb | si , pero ña unica estructura que se puede plegar en el interior es helice alfa |
| centros activos dell ribosoma y en q subunidad se encuentran | centro de decodificacion (en la sub pequeña 30s) centro de actividad peptidil transferasa (sub grande 50s) |
| estructura del centro de decodificacion | 3 sitios A aceptor P peptidil (enl peptidico) E exit |
| que canales tiene el ribosoma | canal d entrada de arnt y canal de salida del peptido naciente |
| centros de reaccion del ribosoma | centro de decodificacion (en la sub pequeña 30s) centro de actividad peptidil transferasa (sub grande 50s) |
| estrctura del centro de decodificacion | 3 sitios A aceptor p peptidil (enl peptidico) E exit |
| donde entra el primer aa arnt y cual es | es la formil metionina entra directamente al sitio p |
| el peptido se pliega por completo fuera del ribosoma | si pero la unica estructura que se puede plegar en el interior es la helice alfa |
| los aa arnt de los sitios .... y ..... interactuan , como? | los de los sitios A y P interactuan por los extrmos 3' (brazo aceptor ) porque estan muy proximos entonces forman el anlace peptidio el amino del sitio a ataca al cooh del sitio P |
| posibles combinaciones , posibles codones | 64 porq tenemos 4 bases que se combinan de 3 en 3 4 elevado a 3 = 64 de los 64 ---> 3 de STOP UAA UGA UAG uno de start ..AUG 60 para todos los AA ARNT |
| codones de stop | todos empiezan por u , tienen u a y g U AA U GA U AG |
| codones de inicio | AUG empueza por A |
| hay solapamiento al leer los codones | no , se leen d 3 en 3 justo puede haberloentre codondes d incio y parada ( acoplamiento traduccional) |
| un aminoacido se transcribe gracias a un unico codon | no porq hay mas codones que aa por btanto un mismo aa puede ser especidicado por varios codones) aunque hay algunos especificos que si que tienen un solo codon como UGG para tiptofano |
| que son los codones sinonimos | loa que codifican para el mismo aa |
| explica por qué un mismo tRNA puede reconocer varios codones sinónimos que codifican para el mismo aminoácido. | por la hipotesis del balanceo de la tercera base es decir un mismo ANTICODON puede reconocer varios CODONES |
| hipotesis del lbalanceo | un mismo ANTICODON puede reconocer varios CODONES (que sean iguales pero difieran en la tercera base) |
| la flexibilidad en la hipotesis del balanceo en q abses esta | en la tercera del codon y la primera del anticodon porque la otras dos se unen por pdh si en la primera del ac hay una INOSINA se puede unir a C A U |
| como se explica la degeneracion del codigo genetico y q quiere decir | es degenerado porque varios codonespueden codificar para el mismo aminoacido por el balanceo que permite esa variedad |
| hay algun transcrito de procariotas que necesite ser procesado | si , el transcrito para ARN rib y ARN t para que sea funcional tiene quse ser fragmentado |
| que arn asas actuan sobre el transcrito de ARNt y ARN r | para ARNribosomico ARNasa 3 para ARN t ARNasa P |
| que le pasa al ARNt y ARN r bacteriano | que se transcriben juntos en un mismo operon luego tiene que ser procesado pa q sea funcional rnasa 3 (endonucleasa) corta y libera el ARN rib 5s /23s/16s rnasaP - corta los extremos para liberar ARNt |
| en eucariotas todos los genes son monocistronicos? | no , el que trnacribe el ARN ribosomal es policistronico , arn 18/5.8/28 son codificados por el mismo gen (arnpol1) el arn 5s se codifica por otro gen independiente (arn pol 3 ) |
| cual es el arn mas abundante en las cel eucariots | el ribosomal con un 75/80% |
| donde se transcriben maduran ensamblas las subunidades del rubosoma | nucleolo |
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