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tema 3 biosintesis
| Question | Answer |
|---|---|
| tipos de mutaciones | puntuales (ya sean transiciones o transversiones) inserciones o delecciones |
| lesiones /mutaciones causadas por hidrolisis | desaminacion de C originando U desaminacion de una metilCitosina que da timina despurinacion de la G --- sitio abasico |
| lesiones o mutaciones causadas por modificacion quimica o radiacion | luz UV oxidacion por ROS alquilacion |
| mecanismos de reparacion ANTES DE LA REPLICACION | proofreading (exonucleasa 3/5 ) adn pol 1 y 3 en procariotas , y en eucariotas la epsilon y gamma - dUTPasa que reconoce uracilos en el ADN y los quita generando un sito abasico |
| enumera los 5 mecanismos de reparacion DESPUES DE LA REPLICACION | 1. missmatch 2. rep directa 3. BER y NER 4. recomb homologa 5. respuesta SOS |
| qn participa en el missmatch repair | mut s (scaner) mut H endonucleasa mut L busca secuencias GATC UVRD helicasa exonucleasas 1 y 7 la uno come en 5/3 y la 7 come en 3/5 comen hasta llegar al error rellenan con la ADN POL 3 ligasa |
| que produce la luz UV | dimeros de timina fotoproducto 6/4 |
| reparacion directa | fotorreactivacion uv - dimeros de timina MTHF - FAD-FADH-dimero ---------------- desmetilacion de guaninas guanina con un metilo en el oxigno 6 metiltransferasa se une covalentemente al metilo y se degradan juntos |
| BER | uracikos en adn dUTP asa sitio abasico , endonucleasa AP , ADN POL 1 , ligasa |
| NER | se detectan uniones incorrectas (pdh) uvrA uvrB (tetramero) uvrA carga a uvrB - desnaturaliza el adn en el sitio del error uvrC endonucleasa que hace 2 cortes (uno en 8 y otro en 5) uvrD helicasa , libera el fragmento cortado ADN POL 1 ligasa |
| como se repara un daño de doble hebra | con recomb homologa |
| causas de une doble rotura DBS | radiaciones ionizantes o lesiones |
| que es imprescindible pa q se produzca recombinacion homologa | extremos asimatricos , romos , el 3 oh tiene que ser mas largo por eso se digiere con exonucleasas en procariotas REC BCD |
| como se llaman los puntos donde se da la recomb homologa | uniones de holiday |
| maquinaria recomb homologa en procariotas | rec BCD rec B helicasa u exonucleasa 3/5 rec C puente entre ambas rec D helicasa 5/3 rec A recubre el adn simple y encuentra homologia con la otra hebra y hace que se unan formando un heteroduplex ruv C corta ruv AB : union holiday desplazar |
| posibles cortes | cortes en el mismo lado -- parcheado , hay hebras sin reocmbinacion cortes cruzados : ayuste ,productos recombinados |
| en recombinacion homologa quien encuentra las secuencias homologas y las une | rec A |
| ruv AB C | en recombinacion homologa pa la union de holiday ruv A : andamio sobre el q se ponen las hebras de adn ruv B :helicasa , abre por un lao y ciertra por atras pa ir desplazando launion de holiday ruv C : endonucleasa |
| que se introduce en el sistema SOS | una ADNpol de baja afinidad , propensa a errores , que meta cualquier cosa , se usan la 4 y la 5 mecanismo de tolerar el daño : sintesis de translesion |
| missmatch repair en eucariotas | mut s alfa y beta escaner mut L alfa beta gamma endonucleasa cortam ambos lados del error exonucleasa EXO1 pol delta rellena ligasa |
| como discrimina el sistema la hebra nueva de la antigua en la reparacion | proc por lo de adeninas metiladas gatc euc por los frag de okazaki y presencia de pcna (abrazadera deslizante) |
| rep directa en eucariotas | fotoreactivacion no tenemos fotoliasas se usa un mecanismo de corta pega |
| ber eucariotas | ADN GLUCOSILASAS (tenemos 11) cada una reconoce un tipo de daño (reconocen bases modificadas quimicamente) , son especificas pero si fallan actua la de seguridad qye es inespecifica rompe . genera sitio abasico , endonucl AP |
| ner en eucariotas | no tenemos fotoliasas por lo que-- reparacion por escision hay dos modelos el dependiente o idnep de arn polimerasa 2 |
| NER dependiente de arn pol 2 (eucariotas) | dimero de timina detectado , para la transcripcion se activa el factor 2 H , y sus subunidades XP D xP B marcan q hay un dañño y abren la hebra 2 endonucleasas XP F y G ADN pol delta ligasa |
| NER indep de arn pol (euc) | dimero de timina reconocido por XP C y E se abre l ahelice endonucleasas XP F y G rellena la adn pol delta ligasa |
| cual es la reparacion acoplada a la transcripcion | la NER de eucariotas |
| que hace que e active un mec de rep por reomb homologa | una rotura de doble hebra |
| recombinacion no homologa en eucariotas | rotura de doble cadena ku 70 y 80 detectan la rotura dna pkcs :es una quinasa que fosforila a artemis (la activa) artemis : exonucleasa 5/3 |
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