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biosintesis tema 4/5
biosintesis examen 1
| Answer | |
|---|---|
| modificaciones del transcrpto de arn en eucariotas | cola poli a en el extremo 3 y una caperiza en el extrmo 5 |
| diferencias entre el transcropto de procariotas y eurariotas | cuando se trascribe el arn en proc ya es funcional pero en euc hay q ponerla la cola y cperuza |
| difernecias gnes q expresan prot de euc y proc | proc policistronicos euc monocistronicos policistronicos es q a partr de un gen salen muchas prot euc un gen una prot |
| cantidad d genoma q se trancribe | en proc todo pero en eucariotas solo un tercio o asi |
| diferencias entre arn pol de euc y proc | eyc tiene 3 diferentes pero proc solo tienen una |
| la arn pol es una holoenzima | si porq tiene parte proteica (apoenzima )y cofactor (mg) |
| eucariotas arn pol 1 | arn rib 5.8s 18s 28s todos acaban en 8 |
| euc arn pol 2 | arn mensajero que dara proteinas arn small arn sno (small nucleolar) |
| arn pool 3 eucariotas | arn rib 5s arn transferente |
| que hace el arn heteronucleoar | sirve de precursor de arn como arn mensajero |
| arn pequeño nucleolar | en el nucleolo modifica qumicamente otros arn como el arn rib "pequeño ayudante del nucléolo", que maquilla y tunea el ARN antes de que se vuelva parte del ribosoma 😎 |
| arn pequeño nuclear | en el nucleo por tanto modifica el arn mensajer |
| que son los non coding elements | transcritos largos de arn q no van a codificar pa proteinas por ejemplo el arn transferente |
| micro arn | es un tipo de arn no codificante (no da lugar a proteinas) regula la expresion genica , se une a transcriptos de arn maduros y hace funcion de silenciamiento |
| donde esta cada polimerasa | arn pol 1 en l nucleeolo 2 nucleoplasma y 3 tb |
| porq la arn pol 1 esta en el nucleolo y el resto no | pq la uno hace arn ribosomal y los riboomas de forman en el nucleolo |
| factores de transcripcion generales y especificos | los generales se unen a la arn pol pero los especificos no se unen a ella , solo ayudan a reclutarla , se unen a secuencias reguladoras tipo silenciadores o activadores |
| tipos de promotores | clase 1 2 y 3 , cada uno se une a un tipo de arn pol 1 2 y 3 |
| partes del promotor de clase 1 | promotor central y un UCE elemento bde control de corriente arriba se unen TF1 al UCE y tb se une la arn pol 1 mediado por TBPs tata binding proteins |
| promotor de clase uno | En los genes del ARN ribosómico mayoritario (pre-rRNA 45S), que luego dará lugar a 18S, 5.8S y 28S. actua con la pol 1 |
| promotor de clase 3 | regula genes que transcribe la arn pol 3 TFIIIC se une a las cajas A y B dentro del gen. TF3C trae a TF3B y esta contiene a la TBP· tata binding protein 3 pero entre TF3B y C hay un hueco donde se une la arn pol 3 |
| que arn pol transcribe en proc y euc el arn mensajero | el procariotas solo hay un tipo de arn pol , y en eucariotas es el tipo 2 , ya que el 1 es el del ribosomoico y el 3 el del tranferente |
| cuantas adn pol tienen euc y proc | euc tienen 3 alfa (primers) delta (retrasada) epsilon (hebra lider) proc tienen 3 -- la 1 elimina primers y relena , 2 repara , 3 la q replica |
| primasa de euc y proc | euc es la adn pol alfa en proc es una enzima llamada dnaG |
| subunidades arn pol en euc y proc | en proc s¡hay solo una de 5 subunidades y en eucariotas hay 3 y la 2 (arn mensajero ) tiene 12 usbunidaes |
| similitudes beta prima , beta , dos alfa , y w | RPB1 β′ Se une al ADN + tiene el CTD (cola reguladora) RPB2 β Participa en la síntesis de ARN RPB3 + RPB11 α (dos subunidades) Ayudan a montar la enzima y unir subunidades RPB6 ω Estabiliza la enzima |
| RBP1 | β′ Se une al ADN + tiene el CTD (cola reguladora) |
| RBP2 | β Participa en la síntesis de ARN |
| RBP 3 Y 11 | α (dos subunidades) Ayudan a montar la enzima y unir subunidades |
| RBP 6 | ω Estabiliza la enzima |
| que cola destaca en la arn pol 2 de eucaritoas | la cola CTD , com un interrptor , en RBF1 sin P se une al promotor P en ser5 - inicia transcripcion P en ser 2 - elonga |
| aminoacidos principales del dominio CTD de RBF1 | prolina y serina (se fosforilara pa transcribir la ser 2 y 5 ) |
| promotor de clase 1 | UCE elemento de control upper coriente arriba , al q se le unen los ft1 promotor centrak |
| promotor de clase 3 | caja tata y caja B se une FT3C depsues el 3B y este contiene TBP q se ybe a TATA |
| donde esta el promotor respecto al inicio de la transcripcion en los de tipo 1 y 3 aguas arriba o abajo? | en los 1 aguas arriba y en los 3 aguas abajo |
| en el promotor de clase 2 que se une aguas arriba del inicio de la transcriocino | FTII B se une a BRE TBP a TATA -------------------aguas abajo TFII D a los DCE Y DPE |
| con que poemos ver que partes del promotor son esenciales | usando enzimas de restriccion y un gen reportero y ver cuando se expresa y cuando bo |
| enhacer | es un elementoque permite reclutar fact de transcrip esepecificos como activadores o represorres y a la arn pol |
| silencer | reclutan represores de la transcripcion pa q la arn pol no pueda actuar |
| insulator , aisladores | marcan el limite entre un gen y el siguiente |
| que modelos hay de formacion del complejo de iniciacion | modelo holoenzima y el escalonado |
| orden en el q se unen los factores de transcripcion en la formacion del complejo cerrado eucariotas | factor 2D +TBP doblan ADN FACTOR II B + II A arn pol II + TFII F |
| orden en el q se unen los factores de transcripcion en la formacion del complejo abierto eucariotas | tras unirse la arnpol con el factor F se unen el E y H delante de la arn pol H tiene activ translocasa dependiente de ATP , abre el ADN y tb activ quinasa --- P la ser 5 pa que salga del promotor |
| que se recluta en la elongacion | se deshace de los factore de transcirp y mete factores de elongacion FET B que tiene cap de fosforilar a la ser 2 de CTD RPB1 tb mete a hSPT y TFII S (snake) |
| quien fosforila a la ser 5 y a la 2 | a la ser 5 la fosforila el factor H pa sacarla del promotor ala arn pol y a la ser 2 la fosforila el factor de elongacion B pa que avance |
| como desenredamos y enredamos de nuevo nucleosomas | complejo FACT |
| como madura el arn m | con la cola la caperuza y splicing |
| pasos pa formar la caperuza | 1. quitarle un fosfato de los 3 q tiene el primer nucleotido ARN TRIFOSFATASA 2 meter un guanililo GUANILIL TRANSFERASA 3 metilar METILTRANSFERASA |
| pasos pa formar la cola poli A | cuando ya bo este fosforilada la ser 5 y si lo este la ser 2 , atraen a CPSF y CStF (el que actua realmente es CPSF) que reconoce la secuecia de terminacion , la secuencia señal poli A corta viene polimerasa poli A , mete adeninas en el extremo 3 yPBP |
| por que esta formado un promotr completo | por promotor central y secuencias reguladoras |
| porque se dice que es conservativo el proceso de transcripcion ? | sigues teniendo el adn intacto |
| porque se dice que es selectivo el proceso de transcripcion ? | se transcribe una parte del genoma no todo como en la replic |
| porque se dice que es asimetrico el proceso de transcripcion ? | porq solo copiamos una de las hebras , en cambio en la replicacion abrimos el adn y copiamos las dos |
| el arn sera igual que la hebra codificante o la molde | codificante 5/3 la molde es la que se obtiene en la replicacion y es 3/5 |
| porque se dice que es multifocal y multicopia el proceso de transcripcion ? | porque se pueden transcribir muchos a la vez multicopia porque podemos tener muchas copias de ARN a partir del mismo gen |
| actividad correctora de la arn pol | no tiene porque como es inestable y de vida media corta si haymutaciones salen prot malas y se degradan facilmente |
| hay hidrolisis de pirofosfato en la trnacrip o soloo en la replicacion | en ambas de hecho en eucariotas es clave para la formacion de la caperuza |
| la iniciacion en procariotas de la transcripcion | el factor sigma es el q une la arnpol al promotor |
| como conseguimos abrir la doble helice en transcrip en proc y euc? | en proc gracias al 2.3 del fctor sigma en euc gracias a TFIIH q tiene actividad helicasa |
| cuando se vuelve irreversible la transcripcion | cuando se abre la helice |
| modelos de iniciacion abortiva | excursiones temporales arrastre de oruga apretujamiento |
| que mecanismos de correccion de errrores hay para la arn pol | edicion pirofosfolitica o hidrolitica |
| quien lleva a cabo la edicion hidrolitica | gre A y B aunque a es el andamio y B es la q tiene la actividad catalitica |
| tipos de terminacion pa procariotas | dependiente de rho (hexamerica) va pillando a la arnpol indep de rho , formandose un bucle (secuencia palindromica) |
| en procarotas o eucariotas pueden darse a la vez la traduccion aun si no ha terminado la transcripcion | en procariotas si pero en rucariotas no se puede porque hay separacion fisica ya que la transcrip es en el nucleo pero la traduccion en el citoplasma (ribosoma) |
| hebra molde sentido | antiparalela 3/5 |
| hebra codificante senrido | 5/3 |
| codon de inicio en la codificante | ATG en la codificante TAC en la molde AUG en el arn |
| regiones mas conservadas evlutivamente del adn de procariotas | la -35 la -10 caja TATA |
| dominios de sigma | destaca el 2.3 helicasa |
| sitios rut | son secuencias de unos 70 nucleotidos , muy conservada , punto de inicio de desplazamiento de la proteina rho (terminacion de la transcripcion enprocatiotas) |
| TFIIS (Transcription Factor IIS): | se une en la fase de elongacion y se encarga de proofreading |
| P-TEFb (Positive Transcription Elongation Factor b): | fosforila a la ser 2 para que la ARN pol II avance a una elongación productiva. |
| como actua FACT | facilitaates cromatin transcription tiene dos subunidades SPT16 y SSRP1 Desestabiliza la interacción entre la histona H2A-H2B y el ADN. Una vez pasa la ARN pol II, FACT ayuda a reensamblar el nucleosoma, reinsertando H2A-H2B. |
| modelos de terminacion de la transcripcion | torpedo y el alosterico o primitivo |
| modelo torpedo de terminacion que prroteinas intervienen | CPSF y cstf que son las q cortan pa poner la cola de poli a , hacen un cambio alosterico en la arn pol 2 , se liberan los factores de elongacion RAT 1 Y HXM2 son exonucleasas , se comen el arn q sobra hasta que llegan a la arn pol y se car |
| modelo alosterico | es espontanea , se pierde procesividad por un cambio conformacional |
| modificaciones posttranscrpipcionales del transcrito de arn | 1 desaminacion de C para dar U (citidina desaminasa) 2. desaminacion de A para dar INOSINA (adenosina desaminasa) es una base de los arn transf 3. inserccion de U |
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