Help
Options
Didn't know it?
click below
click below
Knew it?
click below
click below
Don't Know
Remaining cards (0)
Know
retry
shuffle
restart
0:00
Embed Code - If you would like this activity on your web page, copy the script below and paste it into your web page.
Normal Size Small Size show me how
Normal Size Small Size show me how
MOK - P7
Pytania - biosynteza białek, lipidów, ER, transport pęcherzykowy
| Question | Answer |
|---|---|
| Czym jest ciałko wielopęcherzykowe? | Są ostatnim stadium endosomu przed lizosomem. Do ciałek wielopęcherzykowych trafiają białka znakowane ubikwityną, czyli te przeznaczone do degradacji. |
| Czym są białka ECSRT? | Białka odpowiedzialne za formowanie MVBs, znakowanie i wypączkowanie do wnętrza ciałka wielopęcherzykowego białek (elementów) przeznaczonych do degradacji, zawierają między innymi Tsg101 – białko wiążące ubikwitynę. |
| ECSRT | endosomal sorting complexes required for transport |
| Jaką funkcję pełnią ciałka wielopęcherzykowe? | W kom. EU transport białek do światła lizosomów w celu degradacji odbywa się za pośrednictwem CW. Tam trafiają białka znakowane ubikwityną, czyli przeznaczone do degradacji. Niektóre wirusy mogą wykorzystywać szlak CW aby uciec z komórki. |
| Na czym polega współpraca między ECSRT a ciałkiem wielopęcherzykowym? | Kiedy ciałko wielopęcherzykowe jest gotowe i białka przeznaczone do degradacji posortowane kompleks ESCRT odłącza się od MVB za co odpowiedzialna jest zależna od Vps4 ATPaza. |
| Przykłady zjawisk transportu opierającego się na endocytozie za pośrednictwem receptora | Wchłanianie LDL do komórki, transport żelaza do komórki, transport hormonów peptydowych do komórki np. insuliny, wchłanianie niektórych glikoprotein, odzyskiwanie wydzielonych enzymów lizosomalnych przez receptory M6P błony komórkowej. |
| Jak nazywają się pęcherzyki paliomerowe? | COPI i COPII |
| Jaką funkcję pełnią COPI i COPII? | Pęcherzyki opłaszczone COPI i COPII odpowiadają za transport między ER i cis-Golgim. |
| Jaką funkcję pełni COPI? | COPI przemieszczają się z Golgiego do ER i odpowiadają za recykling SNARE, samych błon, nieposortowanych białek oraz rozpuszczalnych białek światła ER (np. izomerazy disiarczkowej). |
| Jaką funkcję pełni COPII? | COPII transportują białka, które mają zostać posortowane, z ER do Golgiego (zarówno białka błonowe jak i rozpuszczalne. Rozpuszczalne są związane z receptorami). |
| Jak powstają COPI? | Odpączkowanie od cis-AG zależnie od ARF, fuzja z ER. |
| W jaki sposób COP II transportują białka z ER do cis-AG i wewnątrz AG? | Aktywacja Sar 1 przez błonowe GEF -> związanie Sar1 z błoną i rekrutacja białek Sec -> dołączenie innych sec, w tym Sec24(z sekwnecją sortującą DXE) -> odpączkowanie od ER, utrata płaszcza białkowego -> rozpoznanie cis-AG zależne od Rab i SNARE |
| W jaki sposób COPI segreguje białka? | W procesie bierze udział GTP-aza Sar1 i szereg białek Sec, np. Sec24, które rozpoznaje sekwencję sortującą DXE a tym samym rozpoznaje receptory i białka transportowe, które mają zostać przeniesione do Golgiego. |
| W jaki sposób COP I recyclinguje źle posortowane białka z Golgiego? | Rozpuszczalne białka ER mają sekwencję KEDL, rozpoznawaną przez receptor KEDL obecny w błonach pęcherzyków COPI i COPII oraz cis-Golgiego. Jeśli dostaną się przypadkiem do cystern Golgiego są wyłapywane i zawracane do ER w pęcherzykach COPI. |
| Za co odpowiada białko Sec24? | Za rozpoznawanie receptorów/białek transportowych, które mają zostać przeniesione do Golgiego. |
| Jaka jest rola systemu segregacyjno-sekrecyjnego? | Jego rolą jest dostarczenie białek w miejsce gdzie zachodzą modyfikacje potranslacyjne (Golgi), a następnie rozesłanie do docelowych kompartmentów komórki, lub wydzielenie białek na zewnątrz komórki. |
| Jakie elementy mają udział w systemie segregacyjno-sekrecyjnym? | Udział w tym systemie mają zarówno pęcherzyki opłaszczone COPII (ER → cis-Golgi), COPI (cis-Golgi → ER), klatryną (trans-Golgi → endosomy/lizosomy), jak i nieznanym na razie kompleksem białek (pęcherzyki sekrecyjne). |
| Jaka jest rola endocytozy? | Endocytoza – jej rolą jest wchłanianie specyficznie wykrywanych substancji z otoczenia komórki. Biorą w niej udział pęcherzyki opłaszczone klatryną/AP2 |
| Jaka jest rola egzocytozy? | Egzocytoza – jest to proces wydzielania substancji na zewnątrz komórki. Odnoga systemu segregacyjnego-sekrecyjego prowadząca na zewnątrz komórki również jest typem egzocytozy. |
| Jakie są główne systemy transportu pęcherzykowego? | System segregacyjno-sekrecyjny, endocytoza, egzocytoza |
| Czym są ARF i Sar1? | ARF i Sar1 to monomeryczne rozpuszczalne w cytozolu GTP-azy, które są konieczne do asocjacji płaszczy i tworzenia pęcherzyków transportowych. Umożliwiają tworzenie pęcherzyków pokrytych płaszczem, umożliwiają inicjację składania płaszcza. |
| Czym różnią się od siebie ARF i Sar1? | Mają podobny mechanizm działania, ale ARF tworzy pęcherzyki klatrynowe i COPI, a Sar1 tworzy pęcherzyki COPII. |
| Jak działają Arf i Sar1? | Usunięcie GDP przez GEF z kompleksu z ARF lub Sar1 -> związanie GTP, z. konformacyjna -> kotwiczenie przez hydrofob. N-końce > asocjacja płaszczów -> odpączkowanie pęcherzyka, hydroliza GTP -> dysocjacja płaszcza ->osłonięcie m. wiązania dla Rab i SNARE |
| Jak nazywa się Sar1 u drożdży? | Sec12 |
| Po co ARF i Sar1 mają akt. GTPazową? | Aktywność GTPazowa umożliwia demontaż płaszcza, co jest konieczne do fuzji pęcherzyka z błoną dolecelową. |
| Po co komórce transport pęcherzykowy? | Wydzielanie białek na zewnątrz (np. hormony, enzymy trawienne), odżywianie (endocytoza), modyfikacja białek (szlak sekrecyjno-wydzielniczy), biosynteza i transport lipidów do błon, biosynteza integralnych białek błonowych różnych organelli. |
| Czym są kaweole? | Szczególny przypadek tratw lipidowych. Wzbogacone w sfingolipidy i cholesterol, zawierają również białka z rodziny kaweolin. Białka, a masie około 25kDa, przebijają błonę dwa razy, tak, że zarówno C- jak i N-koniec znajdują się po stronie cytozolu. |
| Jaka jest rola kaweoli? | Biorą udział w procesie pinocytozy, przez kaweole do kom. dostają się cząstki HDL oraz metabolity z udziałem białek zakotwiczonych przez GPI. Transcytoza receptorów błonowych, szlaki przekazywania sygnałów poprzez integrację/wchłanianie receptorów. |
| Czym jest pinocytoza? | Nieselektywne pobierania kropli płynu okołokomorkowego ze wszystkim co się w niej znajduje w pęcherzyk. |
| Elementy kompleksu SNARE w wydzielaniu neurotransmitera | VAMP (jedna helisa) pęcherzyków (v-SNARE), SNAP-25(dwie helisy) oraz syntaksyna (jedna helisa) błony presynaptycznej (t-SNARE) |
| Funkcja elementów kompleksu SNARE w wydzielaniu neurotransmitera | Białka VAMP, SNAP-25 i syntaksyna zawierają heptadowe powtórzenia aa pozwalające tworzyć struktury coiled-coil. Po zakotwiczeniu w pęcherzyków neurosekrecyjnych w membranie utworzenie przez SNARE czterech kompleksów zawiniętych w „coiled coil”. |
| Kompartmentacja w komórce eukariotycznej | Kom. eukariotyczne składają się z wielu przedziałów tzw. organellami, oddzielone są od cytozolu systemem różnorodnych błon fosfolipidowych. Każdy typ organellum pełni w kom. ściśle określoną funkcję, a jego błona zawiera charakterystyczne zestaw białek. |
| Które organella posiadają wewnętrzne przedziały? | Chloroplast i mitochondrium. |
| Po co komórce kompartmentacja? | Oddzielenie pozwala na przetwarzanie jednej substancji w różne produkty w różnych organellach. Przykładowo kwasy tłuszczowe transportowane do mitochondrium ulegają szybko degradacji, natomiast w cytoplazmie są estryfikowane, lub transportowane. |
| Jak dochodzi do komunikacji między organellami w komórce? | Komunikacja i wymieniana substancji z cytozolem i między sobą zachodzi dzięki transportowi transmembranowemu (małe cząsteczki) i pęcherzykowemu (makromolekuły). |
| Gdzie odbywa się biosynteza białek? | Głównie na rybosomach w cytozolu i na szorstkiej siateczce śródplazmatycznej (w przypadku białek z sygnałem do ER). |
| Dlaczego białka muszą być sortowane? | Tylko około połowa białek syntezowanych w komórce to rozpuszczalne białka cytozolu. Pozostałe muszą zostać posortowane do poszczególnych organelli. |
| Czym są sekwencje sygnalne? | Krótkie, 20-25 aminokwasowym sekwencjom znajdującym się najczęściej na N-końcach białek. Każdy typ organellum (jądro, mitochondria, chloroplasty, peroksysomy, ER) ma odpowiadającą sobie sekwencję sygnalną. |
| Jak działa sortowanie działek z udziałem sekwencji sygnalnej? | Jest rozpoznawana przez specyficzne receptory na powierzchni organelli, a białka wbudowywane są w błonę organellum lub wprowadzane są przez nią przez specjalne k. błonowe zwane translokonami. W końcu s. sygnalna jest odcinana przez specyficzne proteazy. |
| Jak przebiega transport białek do jądra? | Transport do jądra odbywa się przez pory jądrowe, a sekwencja sygnalna (NLS - nuclear localization signal) nie znajduje się na N-końcu, więc nie jest odcinana przez proteazy. |
| Jaka jest rola ER i AG w procesie sortowania białek? | Białka sekrecyjne, błony komórkowej, błon ER i Golgiego, światła ER i Golgiego oraz enzymy lizosomalne kierowane są najpierw do światła ER, gdzie przechodzą modyfikacje potranslacyjne i są dalej sortowane za pomocą systemów transportu pęcherzykowego. |
| Które białka nie wymagają sortowane? | Mitochondrialne i chloroplastowe białka kodowane przez genomy tych organelli są tam syntezowane |
| Jak oznakowane są białka, których przeznaczeniem jest ER? | Na N-końcu mają 6-12 hydrofobowe aminokwasy. Sekwencja jest usuwana po dostarczeniu do ER. |
| Jak oznakowane są białka, których przeznaczeniem jest mitochondrium? | Na N-końcu mają amfipatyczną helisę o długości około 20-50 reszt aminokwasowych z resztami Arg i Lys po jednej stronie i resztami hydrodobowymi po drugiej. Sekwencja jest usuwana po dostarczeniu. |
| Jak oznakowane są białka, których przeznaczeniem jest chloroplast? | Nie ma żadnych specyficznych sekwencji na N-końcu, ew. grupy aminokwasów bogate w Ser i Thr. Sekwencja jest usuwana po dostarczeniu. |
| Jak oznakowane są białka, których przeznaczeniem są peroksysomy? | Na C!!!-końcu mają tzw. sygnał PTS1 (Ser-Lys-Leu) a na N-końcu PTS2. Sekwencja nie jest usuwana po dostarczeniu. |
| Jak oznakowane są białka, których przeznaczeniem są jądra | Najczęściej 6-7 aa fragment zawierający głównie zasadowe aminokwasy. Nie jest on odcinany w jądrze, a jego lokalizacja w obrębie sekwencji białka nie jest ściśle ustalona. |
| Czym jest retikukulum endoplazmatyczne? | Rozległy system obłonionych spłaszczonych cystern i kanalików, rozchodzących się w znacznej części cytozolu i ciągły z otoczką jądrową. |
| RER | Szorstkie retikulum endoplazmatyczne – nazywane tak dlatego, że na powierzchni ma liczne rybosomy |
| SER | Gładkie retikulum endoplazmatyczne – pozbawione rybosomów. |
| Funkcje ER | Synteza lipidów (SER) oraz białek błonowych i sekrecyjnych (RER), bierze też udział w dojrzewaniu i kontroli fałdowania syntezowanych białek, stanowi magazyn komórkowego Ca2+ oraz służy detoksykacji komórki. |
| Jak przebiega izolacja RER? | W czasie izolacji retikulum ulega porwaniu na mikrosomy. Należy wpierw odfiltrować homogenat od resztek nierozbitych komórek, oddzielić jądra, oddzielić mitochondria, plastydy i lizosomy, a następnie ultrawirować. Pellet powinien zawierać mikrosomy, |
| Czym są mikrosomy? | Mikrosomy - frakcja homogenatu komórkowego, uzyskiwana do badań biochemicznych przez wirowanie miazgi komórkowej; zawiera fragmenty błon szorstkich siateczki śródplazmatycznej (z rybosomami). |
| Rozkład RER i SER w komórce (ilościowy) | Większość komórek ma bardzo mało SER (wyjątek: hepatocyty). Szorstkiego retikulum jest szczególnie dużo w komórkach wydzielających białka na zewnątrz. |
| Dlaczego w hepatocytach jest dużo SER? | Bo odbywa się tam rozkład hydrofobowych toksyn. |
| Które komórki są szczególnie bogate w RER? | Wydzielających białka na zewnątrz, jak np. komórki trzustki produkujące zymogeny albo insulinę. |
| Funkcje SER | Synteza fosfolipidów oraz, w niektórych komórkach, np. hepatocytach, neutralizowanie hydrofobowych toksyn, rezerwuar jonów Ca2+, rola w glukoneogenezie, detoksykacja |
| Jak przebiega synteza lipidów w SER? | Udział w metabolizmie i syntezie kwasów tłuszczowych i fosfolipidów, synteza cholesterolu, enzym reduktaza HMG-CoA jest wew. białkiem błony ER, synteza hormonów sterydowych z cholesterolu, cząstek lipidowych , lipoprotein, synteza ikozanoidów |
| Jaka jest rola SER w glukoneogenezie? | Defosforylacja glukozy, umożliwia wydostanie się glukozy poza kom. wątroby; glukozo-6-fosfataza związana z bł. (występ. w wątrobie, nerkach, jelicie, nie w mięśniach i mózgu) aktywna jest gdy związana ze stabilizującym ją białkiem wiążącym Ca2+. |
| Jaka jest rola SER w detoksykacji? | Ezym- cyt. P-450 związany z bł.; gdy w organiźmie duże ilości związków toksycznych enzymy detox syntetyzowane w wątrobie w dużej ilości i podwaja się ilość ER gładkiego w kilka dni; po usunięciu zw. tok. nadmiar gładkiego ER usuwany w r. lizosomalnych. |
| Jaka jest rola SER w syganalizacji komókowej? | Rezerwuar jonów Ca2+ (zasobnik substancji sygnalizacyjnych), uwolnienie jonów Ca2+ - odpowiedź na sygnał. |
| Specyficzne enzymy związane z błoną SER | Cyt P450 (detoksykacja), glukozo-6-fosfataza, dioksygenaza |
| Jak syntetyzowane są reszty kwasów tłuszczowych do biosyntezy błon? | Mogą być syntetyzowane de novo z acetylo-CoA w cytozolu, pochodzić z bezpośrednio z pożywienia albo z hydrolizy triacylogrliceroli. |
| Jak powstają nasycone kwasy tłuszczowe? | Syntetaza nasyconych kwasów tłuszczowych do 16 atomów węgla przebiega w cytozolu, dłuższe łańcuchy syntetyzowane są w ER. |
| Jak powstają nienasycone kwasy tłuszczowe w organizmie? | Dzięki desaturazom w ER, które odpowiadają za tworzenie kwasów nienasyconych. |
| Jak są transportowane kwasy tłuszczowe w cytozolu? | Przez białka FABP (fatty acids binding proteins), które zamykają je w hydrofobowej kieszeni zbudowanej ze struktur beta. |
| Jak syntetyzowane są fosfolipidy? | Enzymy błony SER po stronie cyt. Kompleks transesteraz produkuje k.fosfatydowy z fosfoglicerolu i 2 cząsteczek acylo-CoA -> fosfataza usuwa r. fosforanową tworząc DAG -> dodanie główki polarnej przez fosfotransferazę -> działanie flipaz |
| Jak powstaje sfingomielina? | Sfingozyna powstaje w ER z palmitoilo-CoA i seryny. Tam dołączona jest przez grupę amidową r. kwasu tłuszczowego. Następnie N-acyl sfingozyna (ceramid) transportowana jest do aparatu Golgiego gdzie dołączana jest fosfocholina i tworzona sfingomielina. |
| Jakie lipidy powstają w SER? | Fosfolipidy, sfingolipidy |
| Jakie lipidy powstają w AG? | Glikosfingolipidy |
| Jakie lipidy powstają w peroksysomach | Plazmalogeny |
| Jak syntetyzowany jest cholesterol? | Wyjściowymi substraty: acetylo-CoA i acetylacetylo-CoA. 1 etap, oraz etapy od mewalonianu do skwalenu katalizowane są przez cyt. enzymy. Etap 2 oraz etapy od skwalenu do cholesterolu są katalizowane przez enzymy związane z błoną SER. |
Created by:
biotech5