DNA - struktura Word Scramble

Embed Code - If you would like this activity on your web page, copy the script below and paste it into your web page.

Normal Size Small Size show me how

Question	Answer
Co charakteryzuje A-DNA?	Helisa prawoskrętna, o podobnej strukturze do dwuniciowego RNA, nici helisy mają przeciwną polarność.
Co charakteryzuje B-DNA?	Helisa prawoskrętna, szeroki i głęboki duży rowek , 10,4 bp na obrót, nici helisy mają przeciwną polarność
Co charakteryzuje Z-DNA?	Helisa lewoskrętna, której szkieletu cukrowy tworzy zygzakowatywzór, puryny i pirymidyny następują po sobie, nici helisy mają przeciwną polarność
Co charakteryzuje wszystkie polimerazy?	Dodają deoksyrybonukleotyd do końca 3' primera, wykorzystując przy tym nić matrycową. Zawierają 3'-5' nukleazę, która potrafi rozdzielać wiązania fosfodiestrowe błędnie przyłączonych deoksyrybonukleotydów.
Jaką funkcję pełni Mg2+ w reakcjach katalizowanych przez polimerazy DNA?	Stabilizuje powstawania wiązania fosfodiestrowego, formuje mostek między końcem 3' primera i fosforanem dNTP, stabilizuje negatywny ładunek pirofosforanu z przyłączanego dNTP.
Dkaczego helikazy są potrzebne podczas replikacji DNA? Czy wymagają ATP?	HHelikazy są potrzebne by rozpleść podwójną nić DNA, tak, aby każda z nich mogła służyć jako matryca dla polimeraz. Ponieważ DNA jest bardzo stabilne, konieczny jest nakład energetyczny w postaci ATP.
Na co mogą wpłynąć cechy topologiczne kołowego DNA?	Mobilność elektroforetyczną, właściwości sedymentacyjne, powinowactwo do białek wiążących się z DNA, podatność nici na rozplatywanie, podatność DNA na działanie ligaz
Czym są topoizomerazy?	Izomery topologiczne lub stereoizomery, które różnią się między sobą tylko liczbą wiązań, jednak mają tę samą masę cząsteczkową. Odpowiadają za relaksację struktur superhelikalnych. Mogą być oddzielone od siebie przez elektroforezę.
Jak działają topoizomerazy?	Ich rolą jest przeprowadzenie DNA z formy T do formy R. Poprzez tworzenie wiązań kowalencyjnych z DNA, rozrywają i powtórnie łączą wiązania fosfodiestrowe. Wymagają NAD+ jako kofaktora.
Jak działa DNA polimeraza I?	Zaangażowana jest zarówno w replikację, jak i w naprawę DNA, ponadto usuwa primer i uzupełnia luki podczas replikacji, posiada zarówno aktywność egzonukleazową 3'-5' jak i 5'-3'
Jak działa DNA polimeraza III?	Zaangażowana w replikację, odpowiada za utworzenie większości wiązań fosfodiestrowych w powstającym DNA, posiada aktywność egzonukleazową 3'-5'
Czym jest holoenzym?	Holoenzym - enzym, który składa się z części białkowej (apoenzym) oraz niebiałkowej (koenzym).
Jakie jest znaczenie podjednostki beta2 DNA polimerazy III dla procesywności syntezy DNA?	Tworzy swoistą klamrę podczas replikacji DNA, która umożliwia enzymowi bezpieczne przesuwanie się wzdłuż DNA.
Czym jest gyraza?	Specjalna topoizomeraza, która potrafi wprowadzać do DNA ujemne skręty superhelikalne. Hydrolizuje DNA, aby zmniejszyć ilość wiązań.
Czym są ligazy?	Ligaza DNA łączy końce DNA w rejonach dwuniciowych - katalizuje tworzenie się wiązania fosfodiestrowego między grupą 3'-OH jednego końca nici i grupą 5'-fosforanową na końcu drugiej nici. Wymaga źródła energii, NAD+ lub ATP.
Dlaczego synteza DNA nie może zachodzić bez syntezy RNA?	Krótkie odcinki RNA są używane jako startery do replikacji DNA w nici wiodącej i inicjują syntezę fragmentów Okazaki.
Czym są widełki replikacyjne?	Miejsce syntezy DNA, przy czym kierunek syntezy jest przeciwny do ruchu widełek (5'-3')
Czym jest oriC?	Miejsce początku replikacji DNA - rozplata nici DNA.
Czym jest nić prowadząca?	Nić syntetyzowana w sposób ciągły.
Czym jest nić opóźniona?	Nić syntetyzowana w sposób nieciągły, za pomocą fragmentów Okazaki w kierunku przeciwnym do ruchu widełek (5'-3')
Jak działa dnaB helikaza?	Zrywa wiązania wodorowe w dwuniciowym DNA, rozdzielając nici, w miejscu początku replikacji DNA razem z białkami dnaA i dnaC.
Czym są ssb?	Single-strand binding protein. NIE ENZYMY. Stabilizują pojedyncze nici DNA, uniemożliwiają reasocjację rozdzielonych przez helikazę dnaB nici.
Dlaczego antybiotyki takie jak nowobiocyna są skuteczne u ludzi?	Ludzie nie mają gyrazy, która ulega inhibicji na skutek działania tych antybiotyków. Bakterie nie mogą już przeprowadzać replikacji, u ludzi replikacja zachodzi prawidłowo.
W jaki sposób komórka syntetyzuje końce liniowego DNA?	Telomeraza, specjalna polimeraza zawierająca własną matrycę, syntetyzuje telomery, zawierające setki tandemowo ułożonych powtórzeń sześcionukleotydowej sekwencji. Takie kompleksy dobrze osłaniają i chronią końce chromosomów.
Co to znaczy, że DNA nie może być syntetyzowane de novo?	Jako, że jest to proces semikonserwatywny, synteza DNA zachodzi tylko na nici matrycowej.
Co wchodzi w skład nukleotydu?	Pentoza (ryboza lub deoksyryboza) + zasada azotowa + reszta kwasu fosforanowego
Czym różni się nukleotyd od nukleozydu?	Nukleozyd to pentoza połączona z zasadą azotową, natomiast nukleotyd to nukleozyd połączony z resztą fosforanową - estry fosforanowe.
Skąd pochodzi energia potrzebna do replikacji DNA?	Z hydrolizy dNTP i hydrolizy uwolnionego pirofosforanu.
W jakim kierunku jest wydłużany łańcuch DNA?	5' -> 3'
Ile miejsc replikacji występuje u prokaryota?	Tylko jedno, ale jedna replikacja goni drugą.
Co wchodzi w skład kompleksu preinicjacyjnego, tzw. prymasomu?	dnaA, dnaB, dnaC, ssb
Do jakich sekwencji wiążą się białka dnaA, którego celem jest rozplecenie DNA w obrębie oriC?	Do fragmentów o długości 9 par zasad, o prostej i rozproszonej konfiguracji.
Jaka jest różnica między replikacją u prokaryota i eukaryota?	U eukaryota - liczne miejsca inicjacji, startery RNA są dłuższe, a Okazaki krótsze, występuje aż 9 polimeraz DNA, nie występuje osobna prymaza, tempo przesuwania się widełek jest o wiele szybsze, występuje osobna egzonukleaza do usuwania startowego RNA.
Czym są Ter?	Odwrócone powtórzenia, odpowiadają za inhibicję helikazy dnaB.
Gdzie występują telomery?	W komórkach macierzystych szpiku kostnego, komórkach zarodkowych, komórkach jelit, komórkach nowotworowych.

Created by: gruszkowa